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夏南牛遗传多样性分析(2)
可见标记一般可以通过肉眼观察到,如颜色、大小、体重、表型形状等。 汪聪勇等人[8]采用微卫星 DNA 标记来分析不同月龄夏南牛的体长、体高、胸围等 5 项生长性状,揭示了夏南牛的各类性状与遗传变异的关系,为夏南牛的选育提供了科学的参考资料。细胞学标记以染色体形态为特征,从染色体的结构、大小、性状和数量(一般指染色体的组型变化)等方面来研究遗传多样性[9]。生化标记是最早出现的一类分子标记,是通过研究蛋白质(包括酶)的多态性,来研究物种遗传的多样性。这几种方法互不排斥,在研究物种遗传多样性方面都能提供有价值的信息,但它们无法鉴别物种在DNA 水平上的不同,发展过程都受到了一定的限制。近年来,生物技术不断发展,一种新型的、理想的遗传标记技术——微卫星DNA 标记逐渐展现出其优越性并得到飞速发展。微卫星DNA 称为短串联重复序列(STR),也叫做简单序列重复(SSR),重复单位一般为 1 至 6 个核苷酸,由 10 到 50 个重复单位串联连接而成[10]。微卫星长度约为200bp,在结构上主要分为两部分,中间的核心序列和外端的侧翼序列[11],这两个序列使微卫星既具有多态性,又具有特异性。某一微卫星位点基因型是否纯合取决于两端的侧翼序列, 若侧翼序列相同, 则基因型为纯和; 反之,则为杂合。因此,可以通过微卫星侧翼区的特异性来判断基因型,首先以提取的DNA 作为模板,源`自*优尔?文.论~文`网[www.youerw.com通过PCR 反应扩增出相应长度的产物,将扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,观察、统计银染显色后的带型,并用生物学软件对其进行分析。此外,微卫星DNA 在真核基因组中广泛存在且密度较高,并具有灵敏度高、遗传稳定、多态性高及易于检测等优点,非常适用于物种遗传多样性的研究[12]。本研究选用微卫星 DNA 作为遗传标记,利用代表性的 14 个微卫星位点对70 个夏南牛个体进行检测,统计分析各座位的等位基因数(Na)等相关指标,从分子水平对夏南牛群体的遗传多样性进行探讨,深入分析其进化潜力,从而为夏南牛遗传资源的保护、利用和今后的推广工作奠定分子学基础。2 材料与方法2.1 实验材料实验动物为夏南牛,所用样品为血样以及冷冻精液共70 份,血样均为颈静脉血。血样和精液分别进行了全血基因组 DNA 提取和冷冻精液 DNA 的提取,共得 DNA 样品 70 份。所用样品的牛均为健康的成年牛
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