1蛋白质复合物及问题描述就现在来说，我们用的最多的来鉴别相关蛋白质复合物的方法就是把这整个网络按照没有方向的图形的形式来表达，之后就利用图聚方法来寻找相关的蛋白质。通过这个方案能够对蛋白质里面一些拓扑形式来探究，进而掌握蛋白质的互相联系，以及推测蛋白质的功能。82993

我们在研究蛋白质的互相关系的时候，过程中会失去相当的内容。由于蛋白质一般都是按照组的样式或者某一个特殊的样式来实现它的作用的。在整个蛋白质的互相关系中，复合物是最基础的组成部分，所以如何准确辨别蛋白质复合物，对于蛋白质的互相关系的研究十分重要的。

2蛋白质复合物识别的方法

学者们试过了运用很多方法来辨别复合物。通过这个图论分析方法能够帮助人们去思考怎样在逻辑上联系这些蛋白质。可以把这些相互联系理解成一幅图，里面的点表示的是蛋白质，边线则表示的是蛋白质的互相关联。在对那些比较重要的子图进行位置选择时，复合物以及路径的辨别是重要的。这个对于图的研究能够促进对于蛋白质网络的进一步了解。在下面我们对几个比较有代表性的蛋白质复合物进行讲解：论文网

1。 基于图聚类的方法

现在，许多研究都是想要通过图来化解蛋白质的互相关联。而针对蛋白质复合物的辨别就是将其互相关系的这个网当作是一副图，将其分类成为很多个子图，这些子图之间都彼此连接。

2。 基于局部密度的聚类

通过这个密度的方法，能够辨别互相关系网里面比较细密的子图，不过通过这个方法并不能保证都能够得到细密的子图，因为一些比较重要的节点互相的联系也可能不是很紧密。

3。 基于层次聚类的方法

这个所谓的层次聚类，其实是源于计算机科学里面的一个算法，目前已经推广到生物科学的探究上了[7]。利用每个节点的联系的紧密程度来将整个关系网分成大大小小的子群体，通过调整边线，这个算法又能够分成分裂和集聚两种[8]。

4。 基于有监督的聚类方法

这个方法的目的不是去推测，而去将那些已经做过的试验深入剖析，从中发现那些隐藏的复合物信息。这里可以通过机器来在那些相关的数据库中得到相应的复合物。