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1)苄基衍生物
单苄基和双苄基衍生物通常是用胺和苄氯在碱存在下进行制备。用选择性的催化加氢法可将双苄基变成单苄基衍生物，一级胺的苄叉衍生物进行部分氢化反应是一个制备烷基苄基胺或芳香苄胺的常用方法。用苄胺进行亲核取代反应，可引入一个氨基（保护形式)，然后在反应后期去掉苄基。合成文生物 H ( 生物素 biotion) 中就是用上述类似方法制备了一个关键中间体。化学家们研究了各种取代的苄基和有关的基团在催化加氢时脱去的难易，发现对位取代基更不容易进行氢解。
2)三苯甲基衍生物
三苯甲基衍生物如单苄基衍生物一样，可用三苯甲基溴化物或氯代物在碱性存在下与胺进行反应制备，也可用催化剂加氢还原脱掉 ;三苯甲基与苄基不同在于，它可以在温和的酸性条件下脱去。
3)烯丙基衍生物
烯丙基胺用于保护咪唑环上的N2H 键。在碳酸钾的存在下腺嘌呤和羟基嘌呤与烯丙基溴在 N，N -二甲基乙酰胺中可得烯丙基衍生物，而在碱性条件下，可将保护基氧化除去。
1.4.1.4形成 C = N 键保护氨基
酮或醛与一级胺反应生成甲亚胺，通称 Schiff 碱。如果是芳香胺，则有时称缩苯胺 (Anil），由芳香醛、酮和脂肪酮形成的 Schiff 碱是稳定的，但脂肪醛与胺形成的Schiff 碱，往往发生羟醛缩合反应而不适用于作保护基。由于芳亚甲基衍生物容易形成而且稳定，因此是应用最广的保护方法。烷基化后可以生成不稳定的季铵盐，由此可得到收率高的纯二级胺。当醛基的邻位有羟基存在时，由于形成氢键而使衍生物更加稳定。芳香亚甲基可以在极其温和的酸性条件下进行水解脱去，且在反应过程中不致发生消旋。可是，由于在某些情况下偶合不成功，致使该方法在应用中有一定的局限性。
1.4.1.5质子化反应和熬合反应对氨基的保护
1）质子化反应
从理论上讲，对氨基最简单的保护方法是使氨基完全质子化，即占据氮原子上的孤电子对，以阻止取代反应的发生，但实际上在使氨基完全质子化所需的酸性条件下，可以进行的合成反应很少，所以，这种方法仅曾用于防止氨基的氧化。然而游离胺在浓硫酸中低温(约0℃) 进行硝化时，则不必先酰化，因其质子化作用已足以保护氨基不致被氧化。氨基质子化后使芳香环的活泼性减弱，还改变取代反应的定位效应。
2）螯合反应
一个与质子化相似而有效的保护方法是，利用氮原子上的孤电子对形成熬合物。
1.4.1.6用含磷有机物保护氨基
1）二烷基磷酰基作为氨基保护基
在合成肽时，用磷酰基作为氨基保护基，对碱较稳定，对酸则敏感易脱去，可与苄氧羰基媲美。
2）亚磷酸二乙酯作为α2氨基酸中α2氨基的保护基
目前在多肽合成中常用的α2 氨基保护基大多属于烷氧羰基型，如 BOC、Z、PMZ 等，这些保护基对碱稳定对酸敏感，易于在酸性条件下脱除，但相应的试剂在制备时需使用剧毒的光气，这无论对实验室制备或工业生产都会带来很多不便，因此，需要寻找能替代它们的价廉易得、稳定且低毒的新α2 氨基保护试剂。亚磷酸二乙酯制备简单、低廉、低毒且相当稳定，试验表明，用它作试剂在温和条件下不仅能与α2 氨基酸酯类反应生成 N 2 DEPP 衍生物，而且还能使α2 氨基酸四烷铵盐 N 2 DEPP 化，然后较易得到 N 2DEPP 2 α2 氨基酸。这些 N 2 DEPP 2 衍生物在碱中稳定，通常在弱酸性条件下也很稳定。
1.4.2 常见的氨基保护基
常见的氨基保护基有三类，分别为烷氧羰基类氨基保护基、酰基类氨基保护基和酰基类氨基保护基。