2 数据来源和方法

2。1 数据的来源

首先需要三维定量构效关系模式的建立,这个模式需要一系列的数据,然而可靠的数据是建立一个成功模式的基础,在一般情况下,数据的来源可以是分为以下三个地方:(1)可直接通过实验获得。换句话说,这是在实验室中测试药物的活性后 合成了大量的新的药物,导出的每个分子药物的生物活性。(2)从已经报道过的文献中收集的报道。理想情况下,其中所述 可靠的实验数据必须在相同的实验环境的实验中测量,并且需要操作者的状态下具有相同的,并且其中被发现的标准样品是学术。 (3)从专口的数据库中收集即这种收集方法是最简单的,但标准的要求会相应的增加了许多。这里给出的数据建立了定量构效三维模型已经被文献报道,实验数据源检索文献是相同的实验室和研究人员参与经验是相同可以,这样的数据是有效的 ,它可用于在三维(3D-QSAR)来构建定量模型结构的活性。

2。2 数据库和叠合来`自+优-尔^论:文,网www.youerw.com +QQ752018766-

找到课题相关的两篇研究EZH2抑制剂的文献，共有67个化合物，本次用来构建3D-QSAR模型苯甲酰胺类衍生物的47个分子来源于文献[2]。从其中筛选了一套拥有35个训练集及12个预测集的研究对象，并依次为其编号。衍生物的生物活性IC50值经过Log转换为pIC50值。所有的化合物的pIC50都集中分布在5。9到8。0之间。选用Sybyl 2。0软件来构建CoMFA和CoMSIA的模型。通过观察所有结构式的活性,即比较其IC50值的大小,我们可以知道第11号分子是所有分子中最好活性最好的分子,就选择它为基础分子。首先在sybyl软件中准确无误地画好分子，使用Powell梯度算法将Gasteiger-Huckel电荷加入到每种化合物并且使其能量最小化，以导出分子中的力场。能量的梯度限制设置成0。005kcal/mol·Å。这样的设置是为了能够获得最稳定的构象。 

表2。2中列出了用于进行3D-QSAR模型进一步研究的化合物的结构,不相同的取代基和每个化合物的IC50值。分子的训练集叠合得出的分子均拥有最高的活