蛹虫草线粒体转录组的生物信息学分析_毕业论文

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蛹虫草线粒体转录组的生物信息学分析

摘要蛹虫草 (Cordyceps militaris)又名北冬虫夏草、北虫草等,具有多种药用功效并且经济价值非常高,已经实现了产业化的人工培养。蛹虫草是一种药食通用的虫生真菌,其在人工培养、菌种选育、分子生物学、活性成分等方面的研究取得了良好的进展。本文概述了蛹虫草的研究进展及本次实验利用已获得的蛹虫草线粒体的部分基因序列,对蛹虫草线粒体细胞色素b,核糖体小亚基蛋白,环氧化酶2的基因及蛋白序列进行生物信息学分析,运用NCBI通过对该段序列的同源性比较分析发现相似度高的其他物种的基因,并通过系统的生物信息学分析去探索这些基因的系统进化、编码蛋白的结构和功能等。通过比对找出其保守域,利用Swiss Model预测出了蛹虫草线粒体细胞色素b,核糖体小亚基蛋白,环氧化酶2的3级结构,为深入开展蛹虫草的相关基因功能及调控的研究提供了丰富的数据资源。86838

毕业论文关键字:蛹虫草;转录组;细胞色素b;核糖体小亚基蛋白;环氧化酶2 

Abstract   Cordyceps militaris, also known as Cordyceps, has a variety of medicinal and economic value is very high, has achieved the artificial cultivation of industrialization。 Cordyceps militaris is a common edible fungus, which has made good progress in artificial culture, selective breeding, molecular biology, active ingredient and so on。 In this paper, the research progress of Cordyceps and the partial gene sequence of the mitochondrial DNA of cordyceps, The Cordyceps militaris mitochondrial cytochrome b, small subunit ribosomal proteins, ring COX-2 gene and protein sequence of bioinformatics analysis, using the NCBI through to the sequence homology comparison analysis revealed high similarity to other species genes, and through the system of bioinformatics analysis to explore the evolution of these genes, the structure and function of the coding protein, etc。。 By comparing to find the conserved domain, using Swiss model predicts the Cordyceps militaris mitochondrial cytochrome b, small subunit ribosomal proteins, oxidative ring element 2 grade 3 structure, to carry out the study of Cordyceps militaris related gene function and regulation provides abundant data resources。

Keywords: Cordyceps militaris; transcription; cytochrome b; ribosomal protein S3;coxidase subunit 2

目  录

第一章 绪论 1

1。1 引言 1

1。2 蛹虫草药理作用 2

1。2。1 调节免疫系统 2

1。2。2 抗肿瘤作用 2

1。2。3 抗氧化、抗衰老作用 3

1。2。4 降血糖作用 3

1。3 蛹虫草功效成分研究进展 3

1。3。1 虫草素 3

1。3。2 虫草酸 4

1。3。3 虫草多糖 4

1。3。4 超氧化物歧化酶 5

1。3。5 无机元素 5

1。3。6 其他功效成分 5

1。4 转录组与蛋白质研究进展 6

1。4。1 转录组研究现状与发展 6

1。4。2 蛹虫草蛋白质研究现状与发展 7

1。4。3 转录组与蛋白质组比较研究发展 7

1。5 细胞色素b (责任编辑:qin)