3730测序仪测序实验干扰因素的研究
时间:2024-02-22 22:04 来源:毕业论文 作者:毕业论文 点击:次
摘 要:3730 DNA测序仪是一款高质量的长片段读取和序列分析的测序平台,在测序方面有诸多优点,是目前应用最广泛的测序仪之一。然而,对于该测序仪测序结果质量影响因素的研究还少有报道。本研究通过将干燥样品在-20℃保存不同时间以及测序胶在常温下放置不同时间,分析其对3730型DNA测序仪测序结果的影响。结果表明样品板在-20℃保存7天与及时测序相比平均信号长度显著下降,而-20℃保存7天与14天无明显差异。测序胶常温放置7天与及时测序相比平均信号强度显著下降,而常温放置7天与放置14天无显著差异。结果表明样品板和测序胶保存时间越长,测序质量越差,应及时测序。94192 毕业论文关键词:3730测序仪,样品板,测序胶,测序质量 Abstract:The 3730 DNA sequencer is a high quality long segment read and sequencing platform, which has many advantages in sequencing and is currently one of the most widely used sequencer。 However, there are few reports on the factors influencing the quality of sequencing results。 In this study, the effects of keeping the dried samples at -20 ℃ for different time and keeping the gel at room temperature for different time on the sequencing results of 3730 DNA sequencer were analyzed。 Results showed that the average signal lengthes significantly decreased after keeping the samples at -20 ℃ for seven days, while there was no significant difference between seven and 14 days。 The average signal intensity was significantly lower after keeping the sequencing gel in room temperatrue for seven days。 There was no significant difference between seven and 14 days。 Thus, the longer the keeping time of the sample plates and the sequencing gels, the worse the quality of sequencing。 So, they should be sequenced in time。来自优I尔Q论T文D网WWw.YoueRw.com 加QQ7520~18766 Keywords: 3730 sequencer, sample plate, sequencing gel, sequencing quality 目 录 1 前言 4 2 材料与方法 4 2。1 主要仪器设备 4 2。2 主要试剂 5 2。3 研究对象 5 2。4 实验方法 5 2。4。1 试验设计 5 2。4。2 样品制备 5 2。4。3 上机测序 6 2。4。4 数据分析 6 3 结果与分析 6 3。1 样品板对测序结果的影响 6 3。2 测序胶对测序结果的影响 8 讨论 9 参考文献 10 致谢 11 1 前言论文网 快速和准确的获取生物体的遗传信息对于生命科学研究具有十分重要的意义。对于每个生物体来说,基因组包含了全部的遗传信息。测序技术能够真实反映基因组DNA上的遗传信息,进而比较全面地揭示基因组的复杂性和多样性,因而在生命科学研究中扮演了十分重要的角色[1]。美国ABI公司生产的3730型DNA测序仪是一款高质量的长片段读取和序列分析的测序平台,应用灵活而广泛[6]。该测序仪采用Sanger双脱氧链终止法进行DNA序列分析。通过Sanger测序技术不仅能够绘制各个物种的基因组图谱,还能探讨不同条件下的基因表达差异以及不同物种之间或物种之内的序列差异,进而为传统生物学和医学研究开辟新的视角。3730型DNA测序仪较之其他测序仪有更多优点:大大提高了数据的产率,超高的光路灵敏度和优化的分离胶保证低成本的获得高质量的基因序列分析数据;显著地改善数据质量,大大降低单一样品分析成本,短时间内可以分析更多样品,并极大地提高了分析能力;高度可靠的多自动化设计使人工操作失误的概率降至最低。 (责任编辑:qin) |