玉米MADS基因家族的生物信息学分析及其功能预测_毕业论文

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玉米MADS基因家族的生物信息学分析及其功能预测

摘要:MADS转录因子在控制开花时间、花分生组织的确定、花器官身份的建立、果实发育、内种皮发育和营养发育等方面发挥重要作用。本文采用生物信息学方法,对玉米MADS转录因子的保守结构域、系统进化关系,并通过对玉米与拟南芥、高粱、水稻的MADS基因组重复比对结果,分析了四种植物间的同源性关系。本研究结果表明:玉米MADS基因的保守结构域具有高度保守性,在基因结构上同源性较高,在进化过程中,水稻、拟南芥、高粱和玉米之间存在一定的亲缘关系。本文对玉米MADS基因的研究为玉米分生组织的发育,玉米胚乳的发育,玉米的抗逆、抗病性等研究提供了有效依据。94620

毕业论文关键词:玉米,MADS基因家族,转录因子,生物信息学

Abstract: MADS transcription factors play an important role in controlling flowering time, determination of floral meristem, establishment of floral organ identity, fruit development, development of testa and development of nutrition。 This paper using the method of biological information, the conserved domain of MADS transcription factor, the phylogenetic relationship of maize, and the corn and sorghum, rice, Arabidopsis MADS genome duplication results, analyzed four kinds of homologous relationship between plants。 The results of this study showed that the conserved domain of maize MADS gene is highly conserved, high homology in gene structure, in the process of evolution, there is a certain relationship between rice and Arabidopsis, maize and sorghum。 The study of maize MADS gene provides an effective basis for the development of maize meristem, the development of maize endosperm, the resistance and disease resistance of maize。

Keyword: maize, MADS gene family, transcription factors, bioinformatics

目  录

1  引言 4

1。1  转录因子概念 4

1。2  MADS家族的起源与进化 4

1。3  MADS基因家族的结构特征 5

1。4  MADS基因家族的生物学功能 6

1。5  MADS基因的研究进展 6

材料与方法 7

2。1  植物MADS转录因子的分类与鉴定 7

2。2  玉米MADS转录蛋白进化树的构建 8

2。3  玉米MADS转录因子家族基因的在线分析 9

3  结果与分析 9

3。1  玉米MADS家族转录因子的鉴定 9

3。2  MADS转录因子家族基因的进化分析 11

3。3  玉米MADS基因的预测基序分析 13

结论 15

参考文献 16

致  谢 19

1  引言

1。1  转录因子概念

转录因子是一类DNA结合蛋白,能够与真核细胞的基因启动子区域的顺式作用组件发生特异性的相互作用。转录因子在转录过程中能够起到起到激活子或者抑制子的作用。[1]目前,科学家们对MADS-box基因展开了广泛的研究。在进行分子进化分析后发现,MADS-box基因家族又可以继续分为AG、AGL6与AP3等13个主要的亚家族。不同基因家族的作用差异也比较大。[2]转录因子具有与真核生物基因的启动子区域的顺式作用组件发生特异性结合的功能,并通过它们之间的相互作用,从而在转录水平上进行基因表达的调节,进而实现对细胞中某些特定生理生和化反应过程进行相关的调控机制。 (责任编辑:qin)