顺乌头酸酶基因的进化分析+文献综述(3)
时间:2017-05-16 21:30 来源:毕业论文 作者:毕业论文 点击:次
2.1.2 真菌 运用DNAstar分析真菌中顺乌头酸酶基因及其所编码的蛋白，其数据如表2所示： 表2 真菌顺乌头酸酶基因及其所编码的蛋白 Table 2 Fungi aconitase genes and their encoding protein 基因 染色体定位 ORF 氨基酸个数 相对分子质量 PI 分子式 酿酒酵母gi|330443681 XII c737548-735212 1-2337 778 85368.3 6.50 C3841H60555N1047O1178S26 白色假丝酵母gi|68488950 1 Ctg19-10251 13419-15794 1-2376 791 85925.3 5.60 C3812H5992N1026O1177S28 盘基网柄菌属 gi|269316126 3 c1171255-1168705 1-2343 771 83542.2 6.19 C3707H5893N1017O1125S26 戴尔凯氏有孢圆酵母 gi|367012608 3 1013104-1015473 1-2370 770 83922.0 6.03 C3716H5869N1013O1149S25 由表可知，酿酒酵母顺乌头酸酶基因定位在XII染色体上，编码区在c737548-735212，编码框在1-2337，蛋白分子式为C3841H60555N1047O1178S26；白色假丝酵母基因定位在1 Ctg19-10251染色体上，编码区在13419-15794，可读框在1-2376，蛋白分子式为C3812H5992N1026O1177S28；盘基网柄菌属基因定位在3染色体上，编码区在c1171255-1168705，可读框在1-2343，蛋白分子式为C3707H5893N1017O1125S26；戴尔凯氏有孢圆酵母基因定位在3染色体上，编码区在1013104-1015473 ，可读框在1-2370，蛋白分子式为C3716H5869N1013O1149S25；真菌中顺乌头酸酶基因编码的氨基酸个数在780左右，蛋白质等电点在5.5~6.5之间，为酸性蛋白。 2.1.3 植物 运用DNAstar分析植物中顺乌头酸酶基因及其所编码的蛋白，其数据如表3所示： 表3 植物顺乌头酸酶基因及其所编码的蛋白 Table 3 Plant aconitase genes and their encoding proteins 基因 染色体定位 ORF(个数) 氨基酸个数 相对分子质量 PI 分子式 拟南芥 gi|240254678 2 2141399-2146678 32 320 36183.0 4.98 C1609H2506N420O498S15 马铃薯 gi|564112057 3.0 scf00122 c809488-807324 13 319 36386.9 5.21 C1646H2571N413O483S16 豆 gi|353336050 1, V1.1 c49188594-49180698 38 308 34844.0 5.41 C1562H2444N408O462S16 葡萄 gi|357773481 12, 12X 6307980-6312506 18 318 35915.2 5.32 C1610H2514N420O474S18 由表3可知，拟南芥顺乌头酸酶基因定位在2染色体上，编码区在2141399-2146678，编码框32个，蛋白分子式为C1609H2506N420O498S15；马铃薯顺乌头酸酶基因定位在3.0 scf00122染色体上，编码区在c809488-807324，编码框13个，蛋白分子式为C1646H2571N413O483S16；豆顺乌头酸酶基因定位在1, V1.1 染色体上，编码区在c49188594-49180698，编码框38个，蛋白分子式为C1562H2444N408O462S16；葡萄顺乌头酸酶基因定位在12, 12X染色体上，编码区在6307980-6312506，编码框18个，蛋白分子式为C1610H2514N420O474S18；植物中顺乌头酸酶基因编码的氨基酸个数在320个左右，与原核生物、真核生物中动物及真菌大不相同，可以推断植物顺乌头酸酶基因起源于与原核生物、真核生物中动物及真菌不同。等电点在5.0左右，为酸性蛋白质。 (责任编辑：qin) |