顺乌头酸酶基因的进化分析+文献综述(4)_毕业论文

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顺乌头酸酶基因的进化分析+文献综述(4)


2.1.4 动物
    运用DNAstar分析动物中顺乌头酸酶基因及其所编码的蛋白,其数据如表4所示:
表4 动物顺乌头酸酶基因及其所编码的蛋白
Table 4  Animal aconitase gene and their encoding proteins data
基因    染色体定位    ORF(个数)    氨基酸个数    相对分子质量    PI    分子式
斑马鱼 gi|312144718    12, Zv9 c20215436-20202853
    50    782    84859.6    7.58    C3754H5973N1057O1132S26
非洲蟾蜍 gi|510884120    Xtropicalis_v7 scaffold_4 74269577-74287341    87    781    85223.1    6.94    C3775H5990N1058O1135S27
猕猴 gi|109156579    10 85427381-85487709    319    780    85347.4    7.62    C3797H6018N1062O1127S24
小家鼠 gi|372099106    4 40143265-40199009    302    780    85463.5    8.08    C3795H6026N1068O1130S24
原鸡 gi|358485482    Z
70787483-70824265    174    785    85791.0    8.04    C3813H6043N1061O1132S29
白领姬鹟 gi|521280571    1A
c50116322-50092727    122    785    85775.1    8.32    C3809H6055N1059O1133S30
智人 gi|568815589    9 32384603-32450836
    314    780    85425.4    7.36    C3769H6016N1064O1131S24
由表可知,斑马鱼顺乌头酸酶基因定位在12, Zv9 染色体上,编码区在c20215436-20202853,编码框50个,蛋白分子式为C3754H5973N1057O1132S26;非洲蟾蜍顺乌头酸酶基因定位在Xtropicalis_v7 scaffold_4 染色体上,编码区在74269577-74287341,编码框87个,蛋白分子式为C3775H5990N1058O1135S27;猕猴顺乌头酸酶基因定位在10染色体上,编码区在85427381-85487709,编码框319个,蛋白分子式为C3797H6018N1062O1127S24;小家鼠顺乌头酸酶基因定位在4染色体上,编码区在40143265-40199009,编码框302个,蛋白分子式为C3795H6026N1068O1130S24;原鸡顺乌头酸酶基因定位在Z染色体上,编码区在70787483-70824265,编码框174个,蛋白分子式为C3813H6043N1061O1132S29;白领姬鹟顺乌头酸酶基因定位在1A 染色体上,编码区在c50116322-50092727,编码框122个,蛋白分子式为C3809H6055N1059O1133S30;智人顺乌头酸酶基因定位在9染色体上,编码区在32384603-32450836,编码框314个,蛋白分子式为C3769H6016N1064O1131S24;动物中顺乌头酸酶基因编码的蛋白质的氨基酸个数在780左右,等电点在7.0~8.5之间,为中性蛋白。 (责任编辑:qin)