番茄逆境响应基因SlNAC10的克隆及生物信息学分析(3)
时间:2021-07-24 15:54 来源:毕业论文 作者:毕业论文 点击:次
(8) 吸出上清,再离心1min,吸出余下的上清;晾干,保证乙醇已挥发,加20mL DEPC水,用枪头来回吸几下混匀,吸出2mL放小离心管中,放冰水上备用跑胶。 2.2.2 RNA反转录 试剂:提取的总RNA、Takara试剂盒 方法:(1)解链,65℃,5min,20μL PCR体系如表1: (2)置于冰上5min (3)反转录反应:42℃,60min,40μL PCR体系如表2: (4)70℃,15min,-20℃保存待用。 表1 PCR试剂使用配方 Table PCR reagent formulation 编号 试剂 使用量 1 H2O 11μL 2 Olig(dT)18 2μL 3 模板RNA 5μL 4 dNTP 2μL 表2 PCR试剂使用配方 Table2 PCR reagent formulation 编号 试剂 使用量 1 5×buffer 8μL 2 inhibitor 1 μL 3 RTM 2 μL 4 H2O 9μL 2.2.3 SLNAC10基因的引物合成及其基因全长的克隆 方法:(1)根据已报道的SlNAC10基因的登录号(XM_004248375),在NCBI数据库中搜索其基因全长序列,并根据该序列涉及其特异性全长扩增引物FNAC10-F/R; (2)以反转录获得的cDNA第一链为模板。用KOD DNA Polymerase聚合酶扩增SlNAC10基因全长。配置50 μL的PCR扩增反应体系如表3,将该体系置于离心管(规格为0.2mL)中离心混匀;文献综述 (3)PCR程序如表4。 表3 PCR试剂使用配方 Table3 PCR reagent formulation 编号 试剂 使用量 1 KOD Buffer 5μL (责任编辑:qin) |