保温结束后,取全部的PCR产物与适量的loading buffer混匀后用1%的琼脂糖凝胶电泳,切胶回收相应条带。
表2-1 PCR反应体系
Table2-1 PCR reaction system
试剂 用量/μl
DNA 1
KOD-Plus-Neo 1
10xPCR Buffer for KOD-Plus-Neo 5
dNTP 5
25mM MgSO4 2.4
CR1386 1
CF94 1
ddH2O 33.6
总体系 50μl
2.4 扩增片段与T载体的连接
先用Axyprep DNA胶回收试剂盒回收PCR产物,按照试剂盒说明书进行操作。取5μl胶回收产物进行琼脂糖凝胶电泳,检测其浓度。
T-A克隆采用TakaRaT-A克隆试剂盒。取4μl回收的DNA与1μl载体pMD18-T Vector混合,再加入SolutionⅠ5μl,混匀后,放置于4℃连接过夜。
2.5 目的菌落的培养
从-80℃冰箱中取出感受态大肠杆菌DH5α,在冰上融化后加入50μl连接产物,混匀后,在冰上放置30min,之后立即在42℃水浴中热激30s,然后在冰上放置2min。此时转化已完成。加入SOC培养基500μl,在摇床上进行预培养60min(37℃、200r/min)。所有操作应在超净工作台上完成源!自`优尔'文"论(文`网[www.youerw.com,确保无杂菌污染。
取出事先倒好的含有AMP的LB平板,在超净工作台上吹干,加入X-Gal(5-溴-4氯-3吲哚-β-D半乳糖苷)40μl、IPTG(50mg/ml)16μl,用涂布棒涂匀整个平板,避光晾干以使药品渗入培养基。将预培养好的感受态细胞4000r/min低速离心30s,吸出部分上清液,将剩余的液体与沉淀的细胞吹打混匀后,吸到平板上,充分涂布。用封口膜将平板封上,37℃倒置培养过夜。
2.6 挑选目的菌落并进行PCR
根据蓝白斑筛选原理,成功导入质粒的菌落将呈白色,因此挑取白色菌落若干,并在另一平板上划线作为备份。将挑取的菌落放入事先配好的PCR反应体系中(表2-2),以相应的纯化DNA作阳性对照,ddH2O作阴性对照。进行PCR(95℃预变性10 min; 95℃变性30s;56.2℃退火30s;72℃ 延伸45s,25个循环;72℃延伸10min;12℃保存。)。PCR完毕后,进行琼脂糖凝胶电泳。
不同薯色甘薯IbC4H基因序列差异比较(3):http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_54085.html