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番茄逆境响应基因SlNAC10的克隆及生物信息学分析(3)

时间:2021-07-24 15:54来源:毕业论文
(8) 吸出上清,再离心1min,吸出余下的上清;晾干,保证乙醇已挥发,加20mL DEPC水,用枪头来回吸几下混匀,吸出2mL放小离心管中,放冰水上备用跑胶。

(8) 吸出上清,再离心1min,吸出余下的上清;晾干,保证乙醇已挥发,加20mL DEPC水,用枪头来回吸几下混匀,吸出2mL放小离心管中,放冰水上备用跑胶。

2.2.2 RNA反转录

试剂:提取的总RNA、Takara试剂盒

方法:(1)解链,65℃,5min,20μL PCR体系如表1:

     (2)置于冰上5min

     (3)反转录反应:42℃,60min,40μL PCR体系如表2:

     (4)70℃,15min,-20℃保存待用。

表1  PCR试剂使用配方

Table  PCR reagent formulation

编号                              试剂                      使用量

1                                 H2O                       11μL

2                                Olig(dT)18                             2μL

3                                模板RNA                   5μL

4                                dNTP                       2μL

表2  PCR试剂使用配方

Table2  PCR reagent formulation

编号                               试剂                             使用量

1                                5×buffer                             8μL 

2                                inhibitor                             1 μL

3                                  RTM                              2 μL

4                                  H2O                               9μL

2.2.3 SLNAC10基因的引物合成及其基因全长的克隆

方法:(1)根据已报道的SlNAC10基因的登录号(XM_004248375),在NCBI数据库中搜索其基因全长序列,并根据该序列涉及其特异性全长扩增引物FNAC10-F/R;

     (2)以反转录获得的cDNA第一链为模板。用KOD DNA Polymerase聚合酶扩增SlNAC10基因全长。配置50 μL的PCR扩增反应体系如表3,将该体系置于离心管(规格为0.2mL)中离心混匀;文献综述

  (3)PCR程序如表4。 

表3  PCR试剂使用配方

Table3  PCR reagent formulation

编号                             试剂                         使用量

1                             KOD Buffer                        5μL 番茄逆境响应基因SlNAC10的克隆及生物信息学分析(3):http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_78896.html

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