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2.3实验方法
2.3.1耳组织DNA的提取[19]
具体操作步骤如下:
1、天平称量约20mg的湖羊耳组织,去毛后置于1.5mL EP管中,编号并剪碎;
2、向每份样品中分别加入500 μL DNA抽提缓冲液和10 μL蛋白酶K,混匀后放置于水浴摇床内振荡消化12-16h(温度为56℃);
3、将消化了一夜的样品取出,分别加入相同体积(约500 μL)的饱和酚,上下颠倒摇匀,10分钟后离心(12000rpm,10min);
4、吸取上清液,加入等体积的酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),混摇10min后离心(12000rpm,10min);
5、吸取上清液,加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),混摇10min后离心(12000rpm,10min);
6、吸取上清液,加入两倍体积的-20℃预冷的冰乙醇,并于-20℃冰柜内静置半小时左右,离心(12000rpm,10min);
7、将乙醇吸除,用预冷(-20℃)的75%的乙醇洗涤,离心(12000rpm,10min)后再次除去乙醇,室温下静置干燥;
8、加入100μL灭菌的DEPC超纯水使DNA溶解,放置于-20℃冰箱内保存备用。
2.3.2 DNA浓度和纯度检测
(1)琼脂糖凝胶电泳检测:
A、实验前将凝胶制胶盘、电泳槽、电泳梳等实验工具洗净并晾干;
B、天平称取0.3g琼脂糖,量取30 mL 0.5×TBE缓冲液混于锥形瓶中,在微波炉中加热融化1 min,即成1%琼脂糖凝胶液;
C、待溶液稍冷却至50-60℃左右时,加入2 μL核酸染料轻摇混匀;
D、将琼脂糖溶液缓慢倒入制胶盘中,插上规格大小合适的电泳梳。在此过程中要避免气泡的产生,若出现气泡应尽快处理。
E、室温自然放置约20min使胶体凝固,后缓慢拔掉电泳梳,并将制胶盘放入加有0.5×TBE缓冲液的电泳槽中;
F、吸取2 μL待检的DNA样品与1 μL 10×Loading Buffer混匀后点样,同时取3 μL的DNA MarkerⅢ上样对比;
G、盖上电泳槽盖,设置电压(150 V)、电流(100 mA),电泳30 min;
H、电泳完毕后,小心取出凝胶,在紫外灯下拍照并保存。来*自-优=尔,论:文+网www.youerw.com
(2)紫外分光光度法检测:
用紫外分光光度仪分别测定样品在波长260 nm和280 nm处的OD值,并计算OD260/OD280,若结果接近1.8,则说明DNA样品较纯。 湖羊TGFBR2基因遗传多样性初步分析(4):http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_81359.html