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多菌灵降解菌株分离和生物学特性研究(4)

时间:2021-09-28 19:56来源:毕业论文
10Taq缓冲液 5 l dNTP (25 mmolL-1) 4 l 正引物 (25 mmolL-1) 1 l 反引物 (25 mmolL-1) 1 l Mg2+(25 mmolL-1) 4 l 超纯水 33。5 l PCR反应条件:95℃,5 min;94℃,30 s;55℃,30 s;7

10×Taq缓冲液 5 μl

dNTP (25 mmol·L-1) 4 μl

正引物 (25 mmol·L-1) 1 μl

反引物 (25 mmol·L-1) 1 μl

Mg2+(25 mmol·L-1) 4 μl

超纯水 33。5 μl

PCR反应条件:95℃,5 min;94℃,30 s;55℃,30 s;72℃,1 min 15 s;循环28次,72℃ 延伸5 min;10℃降温2 min。

1。3。4。2 对PCR产物进行TA克隆

PCR扩增产物为1。5 kb左右的单一条带,回收目的片段。回收的DNA片段酶连至pMD19-T载体,16℃过夜。

酶连体系 10 μl

PCR回收产物 3 μl

T4 Ligase 0。5 μl

10×T4 ligation Buffer 1 μl

pMD19-T载体 0。5 μl

超纯水 5 μl

1。3。4。3 质粒DNA的小量提取

平衡吸附柱:取吸附柱加入200 μl buffer CBS,12000 r·min-1 去废液。取2~4 mL菌液,8000 r·min-1弃上清。加250 μl Solution I,用移液枪重悬。再加入250 μl Solution II,立刻小心并完全地翻转4~6次,从而最大化地裂解菌体,最后形成透明的蛋清状溶液,该过程不长于5 min。加入350 μl Solution III 温和充分翻转8~10次室温放置5~10 min,12000 r·min-1离心5~10 min。准备吸附柱并套有2 mL的收集管,取上清于吸附柱内并6000 r·min-1 离心1 min,除去废液。再往吸附柱中加入500 μl W1 Solution 12000 r·min-1 离心1 min,倒掉废液,在吸附柱中加500 μl Wash Solution。重复用Wash Solution 再洗一次。倒掉废液,12000 r·min-1离心彻底去除Wash Solution,在无菌台上晾5 min。往洁净的1。5 mL离心管套上将吸附柱,对准中心打入30 μl ddH2O。置于37℃,2 min,12000 r·min-1 离心1 min,离心管中得到提取的质粒。

1。3。4。4 降解菌株16S rDNA基因序列测定

挑取转化后能在100 mg·L-1 Amp LB固体培养基上存活单菌菌落,在含有Amp的LB液体试管中培养,在37℃摇床160 rpm条件下培养10~12 h,提取质粒并进行PCR分析,测量准确插入的转化子序列。测序委托南京一道生物科技公司。

1。3。4。5 降解菌株系统发育地位的确定

根据16S rDNA基因的测序结果,登录NCBI进行在线查询分析,同时使用原核生物鉴定数据库EzBioCloud 进行在线比对[16],下载同源性较高的16S rDNA基因序列,将序列导入MEGA 5。0 软件中,用邻接法构建降解菌株的16S rDNA基因系统发育树[17]。来*自-优=尔,论:文+网www.youerw.com

1。4 降解菌株生长量的测定

挑取降解菌株接入LB液体培养基,30℃摇床150 r·min-1培养至对数后期作为种子液。使用分光光度法测定菌株的生长量,OD600表示波长λ=600 nm处的光密度。将定时取样的菌液经6000 r·min-1离心5 min,取去离子水洗涤菌液,离心洗涤重复两次,最后加入等体积无菌水重悬后测定生长量。

1。5 菌株D3对多菌灵降解的研究

1。5。1 测量方法

紫外扫描法:在MSM培养基中接种降解菌株进行培养后,用同等体积的二氯甲烷进行萃取,剧烈混匀5~10 min,静置分层,吸取下层有机相,使用过量的无水硫酸钠去除待测液中的水分。在波长200~350 nm内用紫外-可见分光光度计进行扫描。根据其特征吸收峰的高低来初步判断多菌灵的降解情况。

高效液相色谱法(HPLC):取1。0 mL紫外扫描法中的样液至洁净的1。5 mL离心管,在通风橱中待溶剂挥发。加入1。0 mL甲醇溶解,让0。22 μm的有机相滤器进行杂质过滤。液相色谱条件:液相色谱仪型号为岛津RID-10A;液相色谱柱为C18反相柱,规格为250 mm×4。6 mm×5 μm;流动相为甲醇∶乙腈∶乙酸(30∶20∶0。5);柱温为40℃;流速为1。0 mL•min-1;检测波长为240 nm和280 nm。 多菌灵降解菌株分离和生物学特性研究(4):http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_82392.html

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