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基于SSR标记的小酸浆种质资源遗传多样性分析(5)

时间:2021-10-19 21:29来源:毕业论文
海门市其林贝尔仪器制造有限公司 XW-80A 电热恒温水浴锅 上海森信实验仪器有限公司 DKZ-450B 加热磁力搅拌器 JKIKA WERKR RCT basic 微量移液器(移液枪) GILSON p

海门市其林贝尔仪器制造有限公司 XW-80A

电热恒温水浴锅 上海森信实验仪器有限公司 DKZ-450B

加热磁力搅拌器 JKIKA WERKR RCT basic

微量移液器(移液枪) GILSON pipetman 2ul/10ul/100ul/200ul/1000ul

离心机 Eppendorf centrifuge 5418/5810R

微量紫外分光光度计 BioSpec-nano UV-2401PC

聚丙烯酰胺凝胶电泳系统装置 北京市六一仪器厂 NDCZ-24D

PCR仪 Eppendorf AG 22331 Hamburg

2。3主要实验试剂和部分溶液配方

本实验所涉及主要实验试剂有1×TBE缓冲液、0。1%AgNo3r溶液、NaOH溶液、甲醛、6%PAGE、40%PAGE、Mix、primer-F、primer-R、ddH2O、蒸馏水。

3。实验方法

3。1小酸浆DNA提取

使用Ezup柱式植物基因组DNA抽提试剂盒(生工生物工程(上海)股份有限公司)对82个样品进行DNA的提取。具体提取步骤如下:

①取新鲜的小酸浆叶片1-2片,约50-100mg,于液氮中充分研磨成细小的冻干粉沫,随后将其转移至1。5ml的尖头离心管内,粉末体积占离心管体积的1/3。

②加入1ml的CTAB于离心管内,随后以恒温4℃,12,000rpm的转速离心8分钟。同时在事先设置好65℃的水浴锅内开始预热Buffer PCB。

③取出离心管,用1000ul的枪吸去上清液并弃之,于管中加入600μl事先预热的Buffer PCB以及12μl的β-巯基乙醇,于涡旋振荡仪上混匀或手动颠倒混匀,随后室温下静置2分钟。

④2分钟后,加入与Buffer PCB等体积的600μl氯仿(三氯甲烷),并颠倒离心管,使之充分混匀,4℃恒温,12,000rpm转速下离心5分钟,之后取出,吸取200μl上清液至一个新的干净的1。5ml尖头离心管当中,注意不要吸到中间层变性的蛋白质部分。论文网

⑤加入与上清液等体积的200μl的Buffer BD 颠倒混匀3-5次以及与之等体积的200μl无水乙醇,使其充分颠倒混匀后用1000μl移液枪将其全部加入到吸附柱中,室温下静置2分钟,以10,000rpm的转速离心1分钟,弃去收集管中的废液。

⑥将吸附柱放回收集管当中,用1000μl移液枪加入500μl的PW Solution,在10,000rpm转速下离心1分钟倒掉收集管里的废液,注意PW Solution使用前要事先加入所要求比例的异丙醇。

⑦将吸附柱放回收集管之中,加入500μl的Wash Solution,以10,000rpm的转速离心1分钟,并倒掉收集管中的废液。Wash Solution使用前要加入适量比例的无水乙醇。

⑧将吸附柱放回收集管中12,000rpm的转速离心2分钟。此步骤很重要,可去除残余的无水乙醇,避免影响DNA纯度。

⑨将吸附柱盖子打开,在操作台中风干10-15分钟,彻底晾干吸附柱中所残留的Wash Solution,以避免影响DNA产量及后续的实验。

⑩取出吸附柱,放入新的1。5ml的尖头离心管中,于吸附膜中加入50μl的TE Buffer,室温静置3分钟,再在12,000rpm的转速下离心2分钟,得到的DNA 溶液储存于-20℃的冷藏箱中,避免变性而影响实验。

3。2 DNA的质量与浓度检测

利用生命科学紫外可见分光光度计(BioSpec-nano,UV-2401PC)法来检测DNA浓度含量和纯度:取2ul DNA样品在紫外分光光度计上点样,检测波长在260nm和280nm时的吸收值。读取DNA浓度值,一般在40-70ng/μl, DNA纯度的高低是依据OD260/OD280的比值是否在1。8-2。0的范围之内而定的。随后,对DNA检测结果未满足要求的小酸浆样本进行重提,最后,将符合要求的DNA样品浓度稀释到25 ng•μL-1(一般DNA与水的比例为20比40),最终置于–20 ℃的冰箱冷藏室进行备用保存。 基于SSR标记的小酸浆种质资源遗传多样性分析(5):http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_83184.html

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