7)将RNeasy Mini spin column转移至新的1。5 mlRNase-free离心管中,加入50ul RNase-free 水,于室温静置2 min后12000 rpm离心1 min,滤液即为所得的番茄果实总RNA。
1。2。2 RNA反转录成cDNA
利用Tiangen公司提供的逆转录试剂盒FastQuantRT Kit (with gDNase),进行如下操作:
1)按照下表配制混合液,混匀,然后置于42℃孵育3min,然后置于冰上。
组成成分 使用量
5×g DNA Buffer 2μl
Total RNA 1μl
RNase-free water 补足到10μl
2)在上述体系中依次加入如下试剂,混合均匀后置于37 ℃孵育15 min, 85℃孵育5s后得到的cDNA,稀释5倍可用于后续实验。
试剂 使用量文献综述
10×Fast RT Buffer 2μl
RT Enzyme Mix 1μl
FQ-RT Primer Mix 2μl
RNase-free water 补足到10μl
1。2。3 RT-PCR反应
RT-PCR所用的引物:
PCR1引物 PCR2引物
Primer1:
5’-CGACGACAAGACCCT-CTGC TAGCGGCACAACC-3’
Primer2:
5’-GAGGAGAAGAGCCCT-ATTTGCCTGTGCTTGTGC-3’
Primer 3 (LIC3-TT-LIC2):
5’-CCAGCACGGAACCCTTGAGGAGAAGAGCCCT-3’
Primer 4 (LIC4-TT-LIC1):
5’-AGAGCACACGACCCTTCGACGACAAGACCCT-3’
1)将下列试剂在冰浴上依次加入200μl PCR管中:
试剂 使用量
双蒸水 33μl
模板cDNA 1μl
5×PS Buffer 10μl
2。5mM dNTPs 2μl
Primer1(10μM) 2μl
Primer2(10μM) 2μl
2。5U/μl PrimerSTAR HS DNA聚合酶 0。2 μl
总体系 50μl
2)按照如下参数设置进行PCR 扩增反应:
95℃预变性 2 min来,自,优.尔:论;文*网www.youerw.com +QQ752018766-
95℃变性 30s
58℃退火 30s 30 cycles
72℃延伸 30s
72℃终延伸 10min
16℃降温 30 min
END
3)反应结束后,对PCR产物进行电泳检测,并对正确的片段进行割胶回收,并记为PCR产物 P1。
4)以PCR产物 P1为模板,以primer 3和primer 4为上下游引物,参照上述PCR加样体系和PCR 扩增参数进行PCR反应,并对得到的PCR产物进行电泳检测和割胶回收,记为PCR产物 P2。
番茄DNA甲基转移酶SlMET1基因沉默株系构建及表型观察(3):http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_88012.html