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1.2 好氧堆肥过程
好氧堆肥过程是微生物活动的复杂过程，整个过程包含着堆肥材料的矿质化和腐殖化过程。一般可以利用堆肥的温度变化来作为堆肥过程的评价指标。堆肥主要分为四个阶段，依次分别为升温阶段，高温阶段，降温阶段以及腐熟阶段。每个阶段都有着不同的菌种例如细菌、放线菌、真菌、原生生物等，它们在堆肥过程中发挥着不同的作用。
在升温阶段主要起主导作用的是中温性微生物。在发酵之前，肥料中会存在着各种有害的或是无害的菌类，当温度以及其他条件适宜时，各类微生物菌群开始繁殖，利用内在的养料和微生物来发展自己的群体，数量会有所增加。当温度达到25 ℃以上时，中温性微生物菌类进入旺盛的繁殖期，快速增殖，开始迅速地对有机物进行分解和代谢。此时占据主导地位的是嗜温好氧性微生物，它们会将单糖、淀粉、蛋白质等易分解的有机物迅速分解。微生物在消化过程中会产生热量，热量不断的积累，使得堆肥的温度有所升高，温度的升高也会使消化时间得以减少。研究表明，在堆肥化处理初期的微生物主要是一些无芽抱杆菌、球菌、芽抱杆菌、放线菌、真菌和产酸细菌等中温性微生物利用堆肥化物料中的水溶性有机物，如蛋白质、淀粉类物质，简单的糖等，并分解蛋白质、部分半纤维素和纤维素，微生物自身得到迅速繁殖，同时放出氨、二氧化碳和热量[1]。
高温阶段是指堆温温度上升到50-60℃，进入高温阶段后，高温微生物成为优势菌种，活动最为活跃原来的嗜温性微生物逐渐为嗜热性微生物所代替，微生物种类和数量也逐渐变化。在50℃左右占主导的主要是嗜热真菌，常见的有嗜热真菌(如Thermomyces)，好热放线菌(如Actinomyces thermofuscus和A. thermooidiosporus)、普通小单抱菌(Micromonospora vulBaris)等，其中以放线菌占优势。当堆肥温度上升到60-70℃时，中温性微生物由于温度过高受到了抑制或者死亡，并且除了大多数易腐有机物继续受到分解外，还有一些较难分解的有机物也开始逐渐被分解，如纤维素、木质素等，此时嗜热真菌、好热放线茵、好热芽抱杆菌等微生物的活动占据了主导地位，腐殖质也开始形成。当温度到达70℃以上后，微生物由于温度过高会大量死亡或进入休眠状态，但在各种酶的作用下，有机质仍在继续被分解。同时热量会由于微生物的死亡、酶作用的消退而逐渐降低，当温度再次低至70 ℃以下时，休眠的嗜热性微生物又开始重新活跃起来并会产生新的热量，由于嗜热性微生物分解纤维素和果胶类物质能力较强，所以此时腐殖质也基本形成，堆肥物质也得到初步稳定随之也出现了能够溶解于弱碱的黑色物质。在高温阶段由于温度的原因还可以起到杀菌的作用，例如可以杀死杂草种子、寄生虫卵和病原菌等有害物质。
高温阶段之后，会进入降温阶段。堆肥温度会逐步下降，中温、常温性的微生物会随着温度的降低显著增加，无论是种类还是数量上，并且在这一阶段主要分解较难分解的纤维素以及木质素之类的有机物，同时腐殖化占绝对优势的过程。随着微生物活动的减弱，温度会下降到40℃左右，其中易腐熟的物质己成熟。
最后是腐熟阶段，在这个阶段有机物大部分已经分解和稳定，为了保持已经形成的腐殖质和微量的氮、磷、钾肥等，应使腐熟的肥料保持平衡，随着温度会下降。有机成分在此阶段应处于厌氧条件下，防止出现矿质化。
1.3 影响堆肥的主要因素
通过各种研究可以得知，影响堆肥的因素有很多种，主要包括含水率、有机质含量、通风量、pH、温度、C/N等。
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