摘 要:华鳈(Sarcocheilichthys sinensis)是一种生活于平原地区江河和湖泊中水体中下层的小型鱼类,其肉质鲜美,具有重要的食用、药用、观赏价值。Ghrelin又称为生长激素促分泌素,是脊椎动物的一种脑肠肽,具有促进摄食的功能,并能促进生长激素(GH)释放,参与能量平衡调控和糖类代谢。本研究通过华鳈ghrelin基因克隆、采用生物信息学方法,得出华鳈的ghrelin基因的长度为426 bp,氨基酸编码长度为312 bp。对华鳈的核苷酸序列和氨基酸序列与其他物种的核苷酸和氨基酸序列进行对比分析发现华鳈在核苷酸序列和氨基酸序列与鲤科鱼类相似度较高,亲缘关系较近,与其他鱼类和哺乳动物的相似度较低,亲缘关系远。本研究获得的ghrelin相关信息将为华鳈中该基因的功能研究,以及今后分子标记辅助育种提供潜在可能。94467
毕业论文关键词:华鳈,Ghrelin基因,基因克隆,生物信息学,序列对比分析
Abstract: Sarcocheilichthys sinensis is a small fish living in the bottom water of rivers and lakes in the plain area。 It has delicious meat, and has great ornamental value。 Ghrelin known as growth hormone secretagogue is one of the vital brain-gut peptides in vertebrates and was proved to be an endogenous ligand for growth hormone secretagogue receptor and involved in food intake, growth hormone secretion, energy homeostasis, and carbohydrate metabolism。 In this study, we cloned ghrelin gene of S。 sinensis and found that the length of it was 426 bp encoding a peptide with 312 amino acids。 We also found the similarity of nucleotide sequence and amino acid sequence in S。 sinensis is high with cyprinid fishes, and is low with other species by comparing the nucleotide and amino acid sequences of S。 sinensis with those of other species。 The information of ghrelin obtained in this study can provide potential materials for gene function analysis and furthermore for molecular marker assisted breeding of S。 sinensis。源C于H优J尔W论R文M网WwW.youeRw.com 原文+QQ752-018766
Keywords: Sarcocheilichthys sinensis, Ghrelin gene, Gene cloning, Bioinformatics, Sequence contrast analysis
目 录
1 前言 5
1。1 Ghrelin基因研究概况 5
1。2 华鳈概述 5
1。3 研究目的与意义 6
2 材料与方法 6
2。1 实验材料 6
2。1。1 实验所用仪器 6
2。1。2 实验所用其他材料、试剂 7
2。2 引物设计 7
2。3 总RNA提取 7
2。4 核心片段扩增 8
2。4。1 合成cDNA第一链 8
2。4。2 引物及cDNA处理 8
2。4。3 PCR扩增 8
2。4。4 琼脂糖凝胶电泳及DNA回收 9
2。4。5 Ghrelin基因片段克隆 9
2。5 华鳈及其他物种进化树构建 10
2。6 华鳈及其他物种Ghrelin氨基酸序列对比分析 11
3 结果与分析 11
3。1 华鳈RNA浓度检测 11
3。2 华鳈Ghrelin基因的序列