摘 要:华鳈(Sarcocheilichthys sinensis)隶属于鲤形目、鲤科、鮈亚科、鳈属,是江河、湖泊中常见的小型鱼类。生长激素受体(GHR)属于造血生长因子受体超家族,它通过二聚体的形式与生长激素(GH)相结合,影响生长激素正常功能的发挥。本研究利用PCR技术在华鳈中克隆获得了长度分别为1300 bp、900 bp和800 bp的ghra1、ghra2及ghrb1基因cDNA序列。通过生物信息学技术,分析了华鳈GHR基因核苷酸序列、氨基酸序列与其他物种的亲缘关系,发现其与已知物种GHR基因的氨基酸序列具有较高的相似性,为华鳈后续生长关联性分析及生长调控机制的研究奠定基础。94386
毕业论文关 键 词:华鳈,生长激素受体,GHR,克隆,生物信息学
Abstract: Sarcocheilichthys sinensis belonging to the genus Sarcocheilichthys (Gobioninae, Cypriniformes) is a small fish, commonly living in rivers and lakes。 The growth hormone receptor (GHR), which regulates normal functioning of growth hormone (GH), is a member of the hematopoietic growth factor receptor super family。 The PCR technology was used in this study to clone GHR gene sequences of Sarcocheilichthys sinensis。 Finally, cDNA sequences of ghra1, ghra2 and ghrb1 with respective length of 1300 bp, 900 bp and 800 bp were obtained in S。 sinensis。 Homologous analysis of GHR gene using nucleotide and amino acid sequences with other species indicated that Sarcocheilichthys sinensis has high similarity with fish species that have known GHR gene sequences。 The date got in this study will be useful tools for subsequent researches on mechanism of growth regulation and association analysis between growth traits and polymorphic sites in this gene of Sarcocheilichthys sinensis。
Keywords: Sarcocheilichthys sinensis, Growth hormone receptor, GHR, Clone, Bioinformatics
目 录
1 前言 4
1。1 生长激素受体(GHR)研究概况 4
1。2 华鳈(Sarcocheilichthys sinensis)研究概述 5
1。3 华鳈GHR基因的研究目的与意义 5
2 材料与方法 6
2。1 材料、试剂与仪器 6
2。2 研究方法 6
2。2。1 华鳈RNA的提取。 6
2。2。2 反转录 7
2。2。3 引物设计与合成 7
2。2。4 PCR扩增 8
2。2。5 琼脂糖凝胶电泳和DNA回收 8
2。2。6 GHR基因片段克隆 9
2。2。7 序列比较分析 10
3 结果 11
3。1 华鳈GHR基因克隆和测序结果 11
3。1。1 华鳈提取的mRNA检测结果 11
3。1。2 PCR扩增果 13
3。1。3 GHR 核苷酸序列NJ系统进化树的构建 14
3。1。4 华鳈与其他物种氨基酸多态性序列对比分析 14
4 讨论 22
5 结论 24
参考文献 25
致 谢