摘要：Peroxin（PEX）是一类存在于各种生物的过氧化物酶体生成蛋白，在哺乳动物和酵母中已有较多研究，而在高等植物中还少有报道。本研究采用生物信息学方法鉴定出拟南芥基因组中5个PEX11基因，并对其进行了全面的系统发育和表达分析。基因复制分析表明，没有基因起源于串联重复事件，有2对基因起源于片段复制事件。系统发育分析显示，AtPEX11蛋白可分为2个亚族，第一亚族又可分为2个亚组，说明其成员已经发生了分化；在系统发育树的末端发现了1对旁系同源基因，说明物种特异性扩张是该家族进化的主要动力。基因表达模式分析表明，AtPEX11在不同组织器官中都有表达，多数基因在组织器官混合样品中表达。这些结果为AtPEX11功能的进一步分析奠定了基础。94191

毕业论文关键词：拟南芥，PEX11基因，系统发育分析，表达分析

Abstract: Peroxins (PEXs) are peroxisome biosynthetic proteins that exist in various organisms。 These proteins have been intensively studied in mammals and yeast, but little is known in higher plant。 In this study, 5 PEX11 genes in Arabidopsis thaliana genome were identified by bioinformatics approaches and comprehensive phylogenetic and expression analyses of these genes were performed。 Gene duplication analysis showed that two pairs of genes originated from segmental duplication; no gene originated from tandem duplication。 Phylogenetic analysis revealed that AtPEX11 proteins were clustered into two subfamilies, among which subfamily II were further pided into two subgroups, suggesting that pergence has occurred among this family。 Two pairs of paralogous genes were found at the terminal branches of the phylogenetic tree, indicating that species-specific expansion contributes to the evolution of this family。 Gene expression profile analysis showed that AtPEX11 genes were expressed in various tissues and/or organs; most genes were expressed in the multiple-tissue mixed sample。 These results are useful for further functional studies of AtPEX11 genes。源C于H优J尔W论R文M网WwW.youeRw.com 原文+QQ752-018766

Key words: Arabidopsis thaliana, PEX11 gene, phylogenetic analysis, expression analysis

目  录

1  前言 4

2  材料与方法 4

2。1  拟南芥PEX11基因家族成员的鉴定 4

2。2  染色体分布与基因复制分析 4

2。3  系统进化分析 5

2。4  基因表达分析 5

3   结果与分析 5

3。1  拟南芥中的PEX11基因 5

3。2  AtPEX11基因的染色体分布和复制事件 7

3。3  拟南芥PEX11基因系统发育分析 8

3。4  拟南芥PEX11基因表达模式分析 9

讨论 11

参考文献： 12

致谢 13

1  前言论文网

过氧化物酶体在植物脂质移动、光呼吸、氮代谢、激素代谢、光形态建成和植物病原互作中发挥重要功能[1]。在对酿酒酵母的研究中发现了一组叫做Peroxins（PEXs）的过氧化物酶体生成蛋白，该类蛋白能够调控过氧化物酶体生物合成和功能维持的多种过程，如新的膜结构的组建、基质蛋白导入以及过氧化物酶体分裂和增殖等。目前，已鉴定出的PEX蛋白超过32种，其中PEX11是最早鉴定出调控过氧化物酶体功能的关键基因。研究表明，PEX11家族是目前发现成员最多的PEX基因家族，在促进过氧化物酶体极化、膜的伸长，过氧化物酶体的分裂及数量平衡等方面发挥重要功能。该家族在不同物种间存在显著差异，如在人类、小鼠等哺乳动物中含有3个PEX11p相关蛋白，即PEX11α、PEX11β、PEX11γ。在水稻中发现了5种PEX11p的同源蛋白，而真菌类PEX11家族的组成相对复杂，通常含有1-5个PEX11p[2]。在植物中，5种PEX11蛋白可以分为两类，第一类蛋白（PEX11c、PEX11d、PEX11e）的氨基酸序列几乎完全相同，并且C末端具有保守的氨基酸序列（KXKXX）被认为是内质网识别序列，有助于外被体结合。而第二类蛋白（PEX11a、PEX11b）的同源性只有50%左右[2]。