稻田土壤CO氧化细菌coxL基因多样性研究(2)
一氧化碳脱氢酶（Carbonmonoxide dehydrogenase，CODH）是乙酰辅酶A途径中的一种关键酶，催化以下反应： CO2+2H++2e-→CO+H2O。coxL是编码该酶一个大亚基的功能基因，通过对coxL基因的序列和对该酶生物化学特征的分析，可将coxL基因分为两个不同的类群，Form I或OMP类群（基于Oligotropha、分枝杆菌属和假单胞菌属一氧化碳脱氢酶的类型）和Form Ⅱ或BMS类群（基于慢生根瘤菌属、中慢生根瘤菌属和中华根瘤菌属一氧化碳脱氢酶的类型）[2,3]。但对该酶的一些生物化学的研究证据表明Form Ⅱ编码的酶亲和力较低，不能催化CO氧化反应，因此在土壤环境分析中不考虑携带此Ⅱ型基因的细菌[4,5]。一般利用其I型作为分子标签评估环境样品中一氧化碳氧化细菌的多样性，即从DNA的水平研究采用乙酰辅酶A固碳途径固定CO2的微生物的多样性和生态学特征。