拟南芥中离子组相关基因G1的初定位
毕业论文关键词： 拟南芥；离子组学; 图位克隆；初定位；分子标记
Primary mapping of an ionomic gene G1 in Arabidopsis
Abstract: Considering the adherence of plants, the fluent exchanges of materials and information between soils and plants are fundamental to plant growth. Minerals play a significant role in plant growth as a part of nutrient elements that plants take in from the environment. Knowledge on the ultilization of minerals in plants becomes increasingly available, with the benefits of the omics technologies, such as genomics, ionomics, and their intergration. In this study, we analyzed a mutant showing an abnormal ionomic profile and plant architecture in Arabidopsis thaliana, a well-studied model organism in higher plants. An F2 population was constructed and primary mapping was performed to delimit the corresponding genomic interval. This work provides fundamental data towards map-based cloning of the causal gene(s) and ultimately the underlying ionomic mechanism.
Key words: Arabidopsis thaliana; Map-based Cloning; Primary Mapping; Molecular Marker
目录
引言 1
1 材料与方法 4
1.1初定位原理 4
1.2 供试材料 4
1.3 分子标记的设计 4
1.3.1 InDel分子标记的设计 4
1.3.2 SNP分子标记的设计 5
1.4 群体棍合样品基因组DNA的提取 7
1.4.1取材 7
1.4.2试剂 7
1.4. 3仪器 7
1.4.4方法 7
1.5 群体单株基因组DNA的提取 8
1.5.1取材 8
1.5.2.试剂 8
1.5.3仪器 8
1.5.4 方法 8
1.6PCR扩增 9
1.6.1 材料及试剂 9
1.6.2 PCR产物凝胶电泳 9
2.结果与分析 9
2.1 多态性分子标记的验证结果 10
2.2 F2群体基因型分析 11
3 讨论 12
4.致谢 12
附录 14
引言
建立“功能离子组学”的倡导者——美国加利福尼亚州斯克里普斯研究所的科学家戴文•索尔特说过:“细胞中的全部离子都可对机体生命发挥关键性影响。”[1]随着植物营养科学理论不断完善，目前已确认对植物来说有17种矿质元素属于必需元素 [2，8]。这些矿质元素并不是直接发挥作用，而是溶解于土壤中的水中以离子的形式被植物摄取。因此，植物体内各离子平衡调控的遗传与分子机制成为了植物营养研究的热点。但是，传统的分子生物学手段无法对植物体内复杂的离子调控机制进行深入研究。离子组学作为一个广受关注的新的基因组学研究方法，正逐步被发展完善并应用到植物体内离子平衡调控机制的研究中去。植物的离子组是指有植物内所包含离子的总和，包括了植物体内所有的金属离子、类金属离子和非金属离子。为了解决同时定量分析多个元素的问题，科学家们开发出了现代高通量元素分析等技术(如ICP—MS／OES)。这些技术手段的相继问使得从全基因组上分析和对比植物体内的离子组成为可能，而植物体内控制离子平衡的遗传与分子调控机制的研究前景也逐渐明朗起来[3]。