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呼伦贝尔高原盐湖嗜盐细菌多样性分析(2)
2.3 呼伦贝尔地区嗜盐细菌丰度分析 7
2.4 呼伦贝尔高原地区嗜盐细菌群落的组成情况分析 7
2.4.1 门(phylum)分类单元下嗜盐细菌的群落的组成情况与多样性特征 7
2.4.2 科(family)分类单元下嗜盐细菌群落的组成情况与多样性特征 8
2.4.3 种(species)分类单元下上嗜盐细菌群落的组成情况与多样性特征 9
3讨论 10
致谢 11
参考
文献
11
引言
在地球环境中,除了有比较适宜的条件外,还有一些比较极端的恶劣环境,例如高温,高盐等;除了对土壤生物的研究,还有对水中生物的研究[1-8]。而之前已经有人对生存在盐浓度较高的环境中的一类特殊的微生物——嗜盐细菌进行了很多研究,例如:2008年,Mehmet Burcin Mutlu等科学家分析了土耳其境内一个盐湖内的生物多样性[1];2011年,对从红海得到的海绵内分离出的微生物群体进行测序并分析[2];2008年,汪长东等在舟山深海的海泥底泥内提取到了一株嗜盐细菌,并且分析了其生物多样性特征[3];2013年,崔恒林对新疆地区两盐湖的微生物多样性进行了研究[4];2014年,中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室的闫法军等研究了刺参养殖池塘中的水体微生物群落功能多样性的随着季节的改变情况[5];还有人研究过青海地区七个盐湖的湖底泥内的嗜盐菌的多样性[6]和山西运城盐湖地区的放线菌群落特征[7]。而同时我国地域辽阔,南北地区跨度大,有海洋、内陆地区盐湖[9,10]、盐场、高盐土壤、盐腌制品场等各种盐含量很高的环境,在这些环境中大部分微生物无法生长,但嗜盐微生物却可以很好的适应这种环境,我国的盐湖大多分布在东部,尤其是内蒙古自治区内[10]。
在各些盐浓度很高的环境中,嗜盐菌成为这种条件下最主要的菌种[11]。对于这一类细菌能在盐浓度很高的环境中生存的原因,有很多科学家都对此做出了解释,例如:在高盐条件下,它能产生相溶性物质,比如四氢嘧啶、甜菜碱等,这些相溶性物质可以对嗜盐菌执行渗透保护功能[12-15];能合成某些少见的酶或者一些次级代谢产物,如视紫红质[16-18] 、ß胡萝卜素[19]等;存在一些独特的生理结构,比如紫膜结构[20];在质膜上有一些特殊蛋白质,这些蛋白质可以对嗜盐细菌进行渗透性调节[21-23]。由于嗜盐菌的这些特殊之处,使得它在处理含油废水、抗肿瘤菌的研究等方面有着极大的探究潜能[24--27]。
目前占主流地位的研究水环境中微生物多样性的方法大都是采用纯培养[28,29]。利用纯培养技术可以提纯并且得到目的菌株,但同时也有研究表明,自然环境中能够培养的微生物只占环境中很少的一部分,大部分的菌种在实验室中无法通过纯培养来获得,因此降低了在实验室中研究出的自然界中水体微生物的物种多样性[30],在生产实验中的利用存在着一定的局限性。随着现代分子生物学的发展,像454高通量测序技术、16S rRNA技术等这些免培养技术的不断出现[31-34],改善了上面所说的问题。其中454高通量测序技术是目前发展比较快的一项测序技术,它主要是通过生物发光来进行序列的分析测定,夏围围通过这项技术分析了土壤中的微生物群落[33],向少能等人也用这项技术得到了水中的微生物群落的研究结果[34],由于454高通量测序的测序速度快、成本相对较低、测序
自动化
等优点,而在未来有极大的应用前景[35]。
本研究使用454高通量测序技术对采集所得到的呼伦贝尔高原地区上的盐湖湖水水样中的细菌进行了物种多样性分析,全面了解呼伦贝尔高原地区盐湖中嗜盐细菌的群落组成,为当地嗜盐细菌的资源保护以及开发提供理论依据以及数据依据。
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