摘要：转录因子是一类在植物生长过程中发挥核心作用的蛋白质。本试验通过生物信息学方法对玉米基因组进行搜索，鉴定并获得了43个Dof基因。在获得Dof基因相关信息后，我们对其进行了染色体定位、系统进化分析以及保守基序分析，结果表明Dof基因分布于9条染色体上，并且都具有相当保守的DOf结构域。此外，对Dof基因家族在玉米、短柄草、水稻和高粱间的同源性进行了剖析，确定了部分Dof基因在玉米自身以及玉米与其他物种间存在线性同源关系。以上研究帮助我们进一步认识植物中Dof家族的生物学功能。71507

毕业论文关键词：玉米，Dof转录因子，生物信息学

Abstract:Transcription factors were a protein which had a huge effect on the development of  plants. In the text, we used bioinformatics methods to search the genome in maize and we identified and obtained 43 Dof genes. After getting related Dof genes information, we carried a chromosomal location, phylogenetic analysis and conserved motif analysis, the result showed that Dof genes distributed on nine chromosomes and they had a quite conservative Dof domain. In addition, we conformed that there were intraspecific and interspecific chromosome replication between maize and other plants by chromosome replication analysis. Above all, this study helped us know more about function of Dof genes in a way.

Keywords: maize, Dof transcription factors, bioinformatics  

目  录

1 引言 6

1.1 玉米是高产作物之王 6

1.2 转录因子的定义 6

1.3 Dof转录因子的基本特点 6

1.4 植物中的Dof转录因子 7

1.5 Dof转录因子的系统分类 8

1.6 Dof转录因子的功能 8

2 材料与方法 9

2.1 数据的获取与分析 9

2.2 玉米Dof转录因子家族的系统发育分析 9

2.3 玉米Dof转录因子家族保守motif分析 9

2.4 玉米Dof转录因子家族的全基因组定位 9

2.5 四种单子叶植物中Dof类转录因子家族所在染色体区段线性同源分析 9

3 结果和分析 9

3.1 玉米Dof转录因子家族的鉴定 9

3.2 玉米Dof转录因子家族的进化分析 11

3.3 玉米Dof转录因子家族保守motif分析 13

3.4 玉米Dof转录因子家族的全基因组定位 14

3.5 玉米Dof转录因子在其自身的染色体复制 14

3.6 Dof基因在玉米、高粱、短柄草以及水稻之间的染色体复制 16

结论 19

参考文献 20

致  谢 22

1 引言

1.1 玉米是高产作物之王

   粮食是我们的生存之本，玉米、水稻与小麦作为世界上三大粮食作物，极大程度帮助我们解决了粮食短缺这一难题。按栽培面积和生产总量，这三种作物依次排列为水稻、小麦和玉米。虽然玉米的栽培面积与产量低于水稻与小麦，但是其总产和单产均处于第一位。玉米是高产作物之王主要由于以下三方面：首先，玉米是C4植物，光合效率非常高；其次，杂交技术最先运用于玉米；最后，株型对光合产物的生产和运输十分有利。玉米由于其极高的产量，因而用于生产的各个方面。在畜禽饲料中，玉米作为优质饲料，发展畜牧业。我们一般从三个层次来选择玉米的利用途径：第一，生活水平低时，选择玉米做口粮；第二，生活水平有所提高时，选择细粮代替玉米；第三，生活水平大大提高时，将其作为饲料。在工业生产中，我们利用玉米为原材料加工获得的产品已超过3000种，例如淀粉、糖及保健油。同时，玉米也可以作为其为原料生产可降解塑料、可降解地膜等环保产品，缓解环境污染。论文网