1.5 Dof转录因子的系统分类
系统而又完整的分类对于研究Dof蛋白的结构与功能十分重要。目前,已鉴定出模式植物拟南芥基因组中有37个Dof成员,且大多数成员具有表达产物。以拟南芥核苷酸序列为主,以玉米、水稻部分Dof基因为辅,Yanagisawa将Dof成员分为七大亚族,每个亚族包含Dof域及少数的保守氨基酸;而Li javetzky等将拟南芥和水稻的Dof转录因子在Dof结构域的基础上分为Aa、Bb、Cc和Dd四大亚群;Moreno-Risueno 等又以绿藻、蕨类、苔藓、水稻、大麦、拟南芥及裸子植物七大代表物种116个转录因子的Dof结构域进行分类,最终分为七大亚族A、B、C、D、E、F、G,并推测出2条可能的核定位信号肽。这些系统分类将为其结构与功能研究提供理论指导。
1.6 Dof转录因子的功能
随着生物技术的快速发展,我们已经发现Dof基因能够参与调节植物特异性表达。这些调节主要体现在三个方面,即组织分化、种子发育和代谢调节。在植物组织分化过程中,Dof转录因子主要参与花粉形成、开花响应及花器官的脱落等生理过程,如水稻中的OsDof12可以影响基因Hd3a和OsMADS14的表达,最终影响水稻的开花时间[11];在种子发育阶段,主要起调控种子休眠和萌发、胚乳发育及蛋白贮藏等作用,如谷类植物的胚乳发育过程中,PBFs在种子形成阶段调控储藏蛋白的合成;在植物代谢过程中,大量的Dof蛋白能够调节碳代谢过程中相关基因的表达,如ZmDof1基因能够增强玉米PEPC启动子的转录,然而ZmDof2抑制PEPC基因的表达[12]。来!自-优.尔,论:文+网www.youerw.com
本试验在已知植物Dof基因组序列的基础上,以生物信息学软件为分析手段,鉴定并获得了玉米Dof家族基因序列,并对其进行结构域分析以及同源性分析,从而显示玉米Dof转录因子家族全部具有高度保守的Dof结构域。此外,通过染色体复制研究,明确了部分Dof在玉米本身以及在短炳草、水稻与高粱之间存在种内以及种间的染色体复制。这些研究对我们全面认识植物中Dof家族的生物学功能具有主要意义。