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HIS以收费为中心，将门诊/急诊挂号、核价、收费、配药和住院登记、收费、以及医疗机构人、财、物等资源调配信息，借助信息网络技术进行管理，并采集整合各节点信息，供相关人员查询、分析和决策。
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CIS以患者为中心，以医生临床诊疗行为为导向，借助多种软件应用系统整合患者临床诊疗数据，完成电子化汇总、集成、共享，医务人员通过信息终端浏览辅助诊疗路径、发送医嘱、接受诊疗结构、完成分析，实现全院级别的诊疗信息与管理信息集成，并在此基础上，不断延伸出各类信息应用系统。
GMIS是指通过运用信息和通讯技术把社会医疗资源和服务连接起来整合为一个系统，实现区域医疗卫生服务。
GMIS系统建立的前提是医院内部HIS、CIS系统已经有一定的基础且数据交互不存在障碍，该系统主要体现在区域内医院与医院、医院与各级卫生行政管理机关、医疗保险等机构间的信息互联互通，消除单个机构的信息孤岛现象，以实现资源的共享和优化，以及区域医疗卫生服务的管理。
尽管我国医疗信息化投入增长较快，但与欧美等发达国家仍存在较大差距。我国医疗卫生总费用占GDP的比例仍低于全球平均水平。2013年，全球医疗卫生费占GDP的平均值为6.79%，我国为5.6%，美国高达17.1%。我国医疗信息化投入占医疗卫生费用的比例仍较低。
2012年我国医疗行业IT总花费占医疗卫生总费用的比例为0.59%，而同期美国占比为2%左右。因此，与欧美等发达国家相比，伴随着我国医疗改革的深化以及医疗卫生投入的增长，我国的医疗信息化行业发展潜力巨大。
患者信息管理的过程逐步由以收费为中心发展到以患者为中心，从侧重于运营管理为主的医院管理信息系统（HIS），转变为以临床应用、管理决策为核心的临床医疗管理信息系统（CIS）的推广运用。当前医疗信息化已进入CIS建设的高峰期，推动了临床医疗管理信息化解决方案的市场规模不断增长。
三、我国临床医疗管理信息系统（CIS）开始向深度应用发展
目前，我国大中型医疗机构已经建成了具备基本功能的HIS系统和PACS、RIS、LIS等基础CIS系统，临床医疗管理信息系统建设开始向手术室和ICU等诊疗行为更为密集科室延伸。
根据CHIMA2014年的调研统计结果，医院规划实施的比例超过10%的临床业务信息系统的临床应用分别为手术麻醉信息系统、临床路径系统、临床决策支持系统、医院感染/传染监控系统、内窥镜影像系统、心电图信息系统、体检中心管理系统、远程医疗系统、病理科信息系统、PACS系统、临床知识库系统、超声影响信息系统、重症监护临床信息系统、放射科信息系统和区域卫生信息系统；由此可以看出我国临床医疗管理信息系统在重要科室和核心治疗工具相关领域的应用在不断拓展，处于医院深化相关信息系统应用的阶段。
企业认为走点“捷径”就能应付常态化的频繁检查，那么你想错了！魔高一尺，道高一丈，改革后，药品数据“造假”直接处罚到人，最轻10年，最重终身行业禁入。同时，“上市许可持有人”也被写进法律，法人必须为药品的全生命周期负责，不再只是一个居高临下的决策者 。
可以预见，随着政策的不断改变，愈发严苛的医药质量管理已经成为行业的必然趋势。
然而， 由于医药企业本身规模之庞大，业务之复杂，在长期的生产中质量管理更是流于形式，应对这样的局面，众多医药企业显得有心无力，距离实现成熟的信息化质量管理，仍然困难重重。