在室温下13000 rpm,离心30分钟,弃上清并且沥干。
11) 待酒精完全挥发后,管底呈透明后加入50 l的ddH2O,用于溶解DNA。
12) 用Nano Drop1000测定样品的DNA浓度。
1。2。2定量 PCR技术
1) 向96孔板中的每一个加样孔中加入5 l的SYBGreen反应液,0。5 l的上、下游引物和4 l的ddH2O。
2) 将96孔板放于漩涡仪下30 s,使体系充分混匀。
3) 4000 rpm,离心1 min。
4) 贴上膜,压平。
反应参数设置
T(℃) Duration
第一步 95 10 min
第二步 95 15 s
第三步 58 15 s
第四步 72 20 s
+Plate Read
第五步 GOTO 第二步
39 more times
第六步 Melt Curve65 ℃ to 95 ℃,increment 0。5 ℃
For 5 s +Plate Read
END
反应结束后,将PCR后的产物取5-10 l,进行电泳,检查扩增结果。
1。2。3琼脂糖凝胶电泳
1) 配制胶液:使用天平称取1 g琼脂糖置于250 ml锥形瓶中,用量筒量取100 ml 1xTAE加入其中,为1 %的琼脂糖胶液;
2) 溶解:把胶液放入微波炉中高温加热使琼脂糖全部溶解,取出摇匀胶液;论文网
3) 胶板的制备:将溶解后的胶液进行冷却,并在冷却后约40-50 ℃的琼脂糖胶液中加入数滴Gel Red染料,混匀胶液然后倒入装好梳子的胶槽内,放置约20-30 min进行冷却;
4) 加样:先加入相对应的Marker,在按照顺序分别一一加入5-10 l的样品于样品槽中;
5) 电泳:恒电压190-220 V,电流控制在400 mA以上, 30 min电泳;
6) 观察和拍照:观察显示的电泳图,并保存。
1。2。4 病毒质粒的培养
1) 配制适量的LB培养基(常温下)待用;
2) 在提前紫外消毒过的超净工作台中,分别移取100 l的AMP(氨苄抗性)和TET(四环素抗性)置于两个培养基中;
3) 分别移取ACMV-A和ACMV-B病毒100 l于AMP培养基和TET培养基中;
4) 将两个培养基放于摇床中培养24 h;
5) 第二天取出待用于质粒的抽提;
1。2。5 病毒质粒PCR
将采样后提取的基因组进行PCR扩增,按照如下的PCR,20 l体系进行加样。
2xMix 10 l
上游引物 1 l
下游引物 1l
DNA 1 l
ddH2O Upto 20 l
反应参数设置
T(℃) Duration Cycle
94 DNA甲基化相关基因抗植物双生病毒研究(4):http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_87938.html