2。3。3 金橙II降解酶基因序列分析
将提取的阳性转化子的质粒DNA送测序公司测序,用软件BioEdit进行编辑分析基因序列,将测序结果提交到美国生物技术信息中心数据库NCBI(http://blast。ncbi。nlm。 nih。gov/)中进行核酸的Blast比对。
2。3。4 金橙II降解酶基因重组表达载体pET29a-azo606构建基因片段及表达载体片段的酶切回收
分别提取质粒pMD18T-azo606和表达载体pET29a,同时用限制性内切酶NdeI和XhoI处理这两个质粒。切胶回收基因azo606片段和线性化的表达载体pET29a片段。
酶切体系(10μL):重蒸水:5μL,质粒pMD18T-azo606或pET29a:3μL,10*H缓冲液Buffer:1μL,XhoI酶:0。5μL,NdeI酶:0。5μL,37℃培养3h。
表达载体pET29a-azo606构建
将基因azo606片段和线性化的表达载体pET29a片段16℃过夜酶连。
酶连体系(10μL):重蒸水3。5μL,基因azo606片段4μL,载体pET29a片段1μL,T4连接酶0。5μL,T4连接酶10×Buffer 1μL。
2。3。5 表达载体pET29a-azo606转化到感受态E。coil BL21细胞感受态E。coil BL21细胞制备与转化
方法同本文2。3。2
2。3。6 重组表达载体pET29a-azo606的诱导表达
活化重组表达菌株E。coil BL21(pET29a-azo606),挑取单菌落接种于3mL含50mg/L卡那抗生素的LB试管中,置于37℃条件下,200rpm的摇床上过夜培养。取1mL过夜培养的种子液接种于40mL含50mg/L卡那抗生素的LB培养液中,置于37℃条件下,200rpm的摇床上培养数小时,使菌体浓度的OD600=0。5左右,加入200 μL的0。1M IPTG,置于16℃条件下,150rpm的摇床上过夜振荡培养。5000rpm离心10min,收集菌体,用Tris-HCL(pH8。0)将菌体清洗两遍,再用10ml Tris-HCL(pH8。0)重悬菌体待用。
2。3。7 SDS聚丙烯酰胺(SDS-PAGE)凝胶电泳分析
聚丙烯酰胺凝胶的灌制
参照文献,配制凝胶,并做适当改进。
12%分离胶(15mL):无菌水4。9mL,30%丙烯酰胺混合液6。0mL,1。5M Tris-HCl(pH8。8) 3。8mL,10%SDS 0。15mL,10%过硫酸铵0。15mL,N,N,N’,N’-四甲基乙二胺0。012mL。
5%浓缩胶(5mL):无菌水3。4mL,30%丙烯酰胺混合液0。83mL,1。0M Tris-HCl(pH6。8) 0。63mL,10%SDS 0。05mL,10%过硫酸铵0。05mL,N,N,N’,N’-四甲基乙二胺0。012mL。
电泳
待凝胶制备好后确认浓缩胶凝固后,轻轻拔去梳子,加入适量的SDS-PAGE电泳缓冲液。每个样品上样量为20μL,连接电源,直至溴酚蓝跑至凝胶底部,然后关闭电源。
染色脱色
电泳结束后,小心取下胶片,自来水漂洗一下,加入适量的考马斯亮蓝R-250染色液,置于微波炉中火加热至几乎沸腾,染色10分钟左右。回收染色液,自来水漂洗一下,加入适量脱色液,置于脱色摇床上振荡脱色,中间更换几次脱色液,直至胶片上条带清晰,也可用脱色液过夜浸泡使脱色更充分。脱色后拍照分析。
2。3。8 Azo606纯化文献综述
在重组表达载体构建过程中,通过引物设计去除基因的终止子,而使用载体上的终止子,使其表达产物带有6*His纯化标签。因重组酶带有6*His纯化标签可用镍柱进行亲和层析纯化。
按本文2。3。6的方法获得重组表达菌株细胞,4℃,12000rpm离心10min收集菌体。用Tris-HCL(pH8。0)洗涤两次后重悬菌体。超声波破碎细胞悬液,4℃,12000rpm离心5min去除细胞碎片。将离心后的含有重组蛋白的上清液加入到含Ni-IDA亲和层析柱中,按Ni-IDA使用方法洗涤洗脱目标重组蛋白。将目标重组蛋白洗脱液转移至透析袋中,用透析缓冲液透析数小时脱盐,期间更换透析缓冲液数次。将纯化获得的Azo606经SDS-PAGE检测分析纯化结果。