利用土壤宏基因组文库鉴定微生物抗MAs(III)的分子机制
毕业论文关键词：三价的单甲基砷；抗性机制；宏基因组文库；膜蛋白
Using Metagenomic Approach to explore the molecular mechanisms of methylarsenite-resistants
Abstract：Methylarsenite (MAs(III)) is far more toxic than pentavalent organoarsenic compounds. Many microbes evolve various mechanisms of MAs(III) detoxification. In this study, a molecular mechanism of MAs(III) detoxification from microbes in a paddy soil with As methylation ability had been identified using the metagenomic approach. An membrane protein containing an ArsP homologous region is inferred as the main effect part of the mechanism, and functioned like ArsP as an pump to efflux MAs(III). Here, this study provides an basis for in further identification of the new mechanisms of microbial MAs(III) detoxification.
Key words: Methylarsenite；mechanisms of MAs(III) detoxification；metagenomic approach；membrane protein
目 录
摘要1
关键词1
Abstract1
Key words1
引言（或绪论）1
1 材料与方法2
1.1 试剂、菌株及培养基2
1.2 土壤总砷含量的测定及孔隙水中砷形态的变化 2
1.2.1 土壤总砷含量的测定2
1.2.2 土壤的淹水培养及孔隙水中砷形态变化的测定3
1.3 土壤总DNA的提取3
1.4 酶切建库3
1.4.1 测定E．coli菌株DH5α对MAs(III)的抗性3
1.4.2 鸟枪法构建基因文库示意图4
1.4.3 酶切体系建立4
1.4.4 凝胶电泳回收酶切片段4
1.4.5 酶连体系5
1.4.6 转化及基因文库的构建5
1.5 基因序列分析6
2 结果与分析6
2.1 信阳稻田土壤孔隙水中砷形态和含量的变化6
2.2 土壤总DNA提取和Sau3AI酶切6
2.3 阳性克隆子的获得7
2.4 阳性克隆测序和分析8
3 讨论 8
致谢9
参考文献9
利用土壤宏基因组文库鉴定微生物抗MAs(III)的分子机制
砷是一种有毒的类金属元素，在环境中分布广泛。近年来，由于采矿、冶炼、含砷废水的灌溉和含砷农用化学品的使用等人类活动，全球大面积的稻田土壤遭到砷的污染，尤其是南亚及东南亚地区[1,2]。稻田土壤砷污染不仅会影响水稻的生长与产量，还会导致稻米中砷的累积。砷通过稻米进入人体后，会与人体内含硫基的酶结合致其失活，影响人体细胞的正常代谢[3]。如果长期摄入低剂量的砷，砷就会在体内逐渐蓄积，引起慢性中毒，干扰人体正常表皮、神经、呼吸、心血管、造血、免疫、内分泌、肝脏、肾脏、生殖等系统，导致这些系统的功能发生紊乱，引起一系列的疾病[4]。
砷是一种还原性的元素，在淹水的稻田环境中可被微生物转化为甲基砷，例如五价的单甲基砷【MAs(V)】、五价的二甲基砷【DMAs(V)】及五价的三甲基砷，另外它亦可以被转化为挥发性的气态胂。五价甲基砷的毒性一般要比无机的三价砷【As(III)】与五价砷【As(V)】低，但其三价还原态物质的毒性却远高于无机砷。Petrick等[5]使用人体肝细胞评价了MAs(III)的毒性，他发现MAs(III)的细胞毒性远高于As(III)，大约是后者的26倍。稻田环境中甲基砷的另一重要来源是农用含砷化学品如MAs(V)的使用等，当这些五价的甲基砷进入环境后可被微生物还原转化为剧毒的三价甲基砷。Yoshinaga等[6]从佛罗里达州高尔夫球场的土壤中分离得到了一株伯克霍尔德菌，研究发现该菌株可以在室温条件下将土壤富集液中的MAs(V)还原成MAs(III)。MAs(III)的高毒性也迫使环境中的微生物进化出了多种应对机制，例如：ArsP可调控细胞外排MAs(III)[7]，ArsH可将MAs(III)氧化为MAs(V)[8]，ArsI催化MAs(III)的去甲基化[9]，最近发现的一类三半胱氨酸型ArsMs如AfArsM可将MAs(III)进一步甲基化为五价的二甲基砷以及挥发性的气态胂[10]。除此之外，微生物中是否还存在其他的MAs(III)解毒机制，尤其针对特定环境例如稻田土壤中的微生物，我们依然知之甚少。