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小麦类黄酮的研究进展及生物信息学分析(2)
2.2.4 小麦黄烷酮-3-羟化酶的亚细胞定位 8
2.2.5 小麦黄烷酮-3-羟化酶的跨膜结构域预测 9
2.2.6 小麦黄烷酮-3-羟化酶的保守域预测 9
2.2.7 小麦黄烷酮-3-羟化酶的信号肽预测 10
2.2.8 三种小麦黄烷酮-3-羟化酶的紊乱区、球形区预测 12
2.2.9 二级结构分析 13
2.2.10 三级结构预测 14
2.2.11 对三级结构预测结果的评价 14
2.2.12 小麦黄烷酮-3-羟化酶的进化树构建 16
3 结论与讨论 18
参考
文献
18
致 谢 20
小麦类黄酮研究进展及生物信息学分析 引言
类黄酮是在性质和结构上不同的多酚类化合物。在蔬菜、水果、坚果、种子和花等植物器官中都有合成。类黄酮根据其化合物结构不同可被分为查耳酮、黄酮、黄酮醇、黄烷双醇、花色素苷和缩合单宁等6 种主要类型,另外还有一些衍生物如异黄酮等[1] 。类黄酮有很多的生物学功能,对人体有很大的作用,例如有消炎、抗病毒、抗细菌、抗过敏[1-3]和抑制血管舒张等的作用。类黄酮主要是通过抗氧化作用、自由基清除作用及二价阴离子螯合作用来实现这些重要的生物学功能[4]。
小麦(Triticum aestivm)为禾本科植物,是人类主要的粮食作物之一。在我国小麦种植面积占了农作物种植面积的很大比例,但我国种植小麦的地域有限,而且在小麦生长发育过程中,由于天气的原因,会经常受到低温、寒害、干旱、高盐和病虫害等逆境的胁迫,这样就对小麦的品质和产量产生严重影响[5]。小麦类黄酮与小麦的抗逆性密切相关[6],进一步了解小麦类黄酮对小麦抗逆性育种具有重要意义。目前关于小麦类黄酮的进化研究报道还较少,本实验从NCBI蛋白数据库下载所有小麦类黄酮以及类黄酮合成过程关键酶的序列;并按照序列特点和结构域进行聚类和进化分析;然后通过与其它植物同源蛋白比较进行进化分析。为进一步研究小麦类黄酮奠定一定的理论基础。
1类黄酮及黄烷酮-3-羟化酶研究进展
1.1 类黄酮的研究进展
类黄酮是植物在进化过程中,为了抵抗恶劣的生存环境,而产生的一类次生代谢物,大多都有颜色,是药用植物的重要活性成分之一[7-8]。绝大多数的植物能合成,在植物的花、果实和叶等器官中多以苷类形式存在,以游离态存在植物的木质部中[7, 9]。类黄酮在植物的生长发育过程有研究,主要集中在植物花色;植物雄性不育;植物抗菌、抗病等方面。类黄酮在医药方面的研究进展主要是在抗氧化及清除自由基活性、防癌、抗癌、心血管疾病、免疫调节等方面。正因为类黄酮的研究对人类生产生活有很大的意义,故近些年来,对类黄酮生物活性和结构分析也越来越受重视。
1.2 黄烷酮-3-羟化酶的研究进展
类黄酮在人类的生产生活中有着非常重要的意义,故其生物合成对人类来说也非常重要。在类黄酮生物合成途径中黄烷酮-3-羟化酶(Flavanone 3-hydroxylase)是一个关键酶[10]。黄烷酮-3-羟化酶的研究方向有在花青素的调控作用、类黄酮的调控作用、染色体的位置及其同源性基因。这些研究对植物合成类黄酮、花青素等多酚类物质非重要,故对黄烷酮-3-羟化酶(F3H)的研究有重要的意义。
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