小桐子JcPDS基因的克隆及生物信息学分析
毕业论文关键词：小桐子；八氢番茄红素脱氢酶；基因克隆；生物信息学
Cloning and Bioinformatic Analysis of The PDS Gene
in Jatropha curcas
Abstract: Jatropha curcas is a woody plant belonging to the Euphorbiaceae, the seed oil content of 40%~60%, it is a good raw material for processing the bio fuel. This thesis mainly carried out for phytoene desaturase’s cloning and bioinformatic analysis. The results show that: The single band of 1.8kb was obtained after PCR amplification, that is PDS gene, its genetic structure contains 15 exons and 14 introns. In the evolutionary tree Jatropha curcas and Ricinus communist was first classified as a class, had the closest relationship. These results provide a basis for the prediction of PDS gene function of Jatropha curcas.
Keywords: Jatropha curcas L.; PDS; Gene cloning; Bioinformatics
目 录
摘要 1
关键词 1
引言 1
1.小桐子的研究背景 2
1.1小桐子的生物学特征 2
1.2小桐子的用途 2
1.3小桐子的研究进展 3
2.植物类胡萝卜素研究进展 3
2.1植物类胡萝卜素组成 3
2.2类胡萝卜素功能 3
2.2.1光合作用的辅助色素 4
2.2.2光保护作用 4
2.2.3参与其他物质合成 4
2.3类胡萝卜素的生物合成途径 5
2.4 PDS基因的研究进展 5
2.5类胡萝卜素对小桐子生长发育的影响 5
3.本研究的目的和意义 5
4.材料和方法 6
4.1实验材料 6
4.2实验试剂 6
4.3常用酶 6
4.4 PCR引物 6
4.5实验方法 6
4.5.1硅胶法提取小桐子RNA 6
4.5.2反转录为cDNA 7
4.5.3 PCR扩增 7
4.5.4琼脂糖凝胶电泳 8
4.5.5 DNA 片段的回收 8
4.5.6 测序 9
5. 结果与分析 9
5.1小桐子PDS基因克隆分析 9
5.2小桐子PDS基因的结构分析 9
5.3小桐子与其他物种的PDS蛋白序列的同源性分析 10
5.4小桐子与其他物种的PDS基因的氨基酸序列的保守性分析 11
5.5小桐子与其他物种的PDS基因的系统进化树 15
6.总结 15
参考文献 16
致谢...... 18
小桐子JcPDS基因的克隆及生物信息学分析
引言
小桐子是属于大戟科麻疯树属多年生的木本植物，落叶灌木或小乔木，别名麻疯树、老胖果、羔桐、臭油桐、黄肿树、假花生等，原产美洲热带，现广布于全球热带地区。在我国福建、广东、海南、广西、贵州、云南等省区也有栽培或少量野生[1]。小桐子可提炼出不含硫、可再生的生物柴油，是我国重点发展的绿色能源植物。
小桐子是一种综合利用价值很高的生物能源原料植物[2]，其种子的含油率高达40%-60%，而且流动性好。从小桐子中得到的新式燃料适用于各类柴油发动机，而且环保可再生。另外，利用小桐子还可以生产多种化工产品，小桐子的树皮可以用来制造染料和单宁酸，果壳和种壳可以加工制造活性炭。此外，小桐子还具有一定的药用价值[3]，有研究证实，小桐子体内一些成分具有杀虫、杀菌和抗病毒活性等。因此，麻疯树油在工业用油，开发新的药物，病害虫生物防治等方面也具备潜在的应用价值，具有广阔的开发利用前景，解决麻疯树的生产状况已成为亟待解决的问题。