HAT模块中GCN5与sgf29亚基的结构分析与功能研究(2)
然而，组蛋白乙酰化型态的众多全基因组图研究表明，在酿酒酵母中，Gcn5环型乙酰化 H3K9，H3K14，并且 Gcn5 结合在启动子和最高度转录基因的 5’编码区之间[14,15,16,17,18]。另外，裂殖酵母 Gcn5的全基因组分析表明，考虑到 Gcn5 是在活跃转录基因的编码区内发现的，并与 H3K14的高乙酰化水平相关，所以 Gcn5 还可能在基因伸长方面有一定的作用[19]。HAT模块中的 Sgf29 亚基在 2002 年由 Sanders 等人鉴定为 SAGA 复合物的一个新组分，也是一个高度保守的亚基[20]，它由245 个氨基酸组成。通过生物信息学分析后表明，Sgf29亚基由两部分组成，包括N 端的 coiled—coil 结构域和 C端的 Tudor结构域。Kurabe 等人在小鼠体内做相关实验发现， Sgf29可以通过N端coiled-coil结构域与Ada3有直接的相互作用，并能调控 c-Myc 靶基因的表达，与 c-Myc 介导的肿瘤的形成和恶性转化有关[21]。后来人们通过质谱实验发现，sgf29 可以特异性地识别甲基化的 H3K4，特别是 H3K4me3（histone 3 lysine4 trimethylation ），之后的实验又进一步证实Sgf29 是通过其上的Tudor结构域识别并结合H3K4 的甲基化修饰物。Sgf29 的缺失会影响 SAGA复合物与 H3K4 甲基化修饰物的结合，这表明 Sgf29 对调控 SAGA复合物识别甲基化H3K4 具有重要作用[22]。虽然关于 GCN5以及 Sgf29 的很多研究成果已经有了报道， 但还是有很多问题遗留下来，包括：（a）SAGA的其他模块或者亚基有助于提高GCN5 的活性吗？（b）Sgf29 是否会参与调控 SAGA 复合物中乙酰转移酶及去泛素化酶的活性？（c）组蛋白乙酰化对 SAGA去泛素化酶的活性有什么影响？（d）HAT模块能控制去泛素的活性吗？（e）Sgf29 是如何结合甲基化 H3K4 的，即它的分子机制是怎样的？我们需要通过实验来进一步诠释各个模块，各个亚基之间的相互作用， 以及它们特异的结构所对应的功能。 本课题通过构建HAT模块的GCN5亚基和 sgf29 亚基的表达载体，采用大肠杆菌表达系统，得到这两个亚基的蛋白样品。