2.2体视显微镜下的观察
1) 取材:挑取赤拟谷盗和杂拟谷盗成虫各30头,分别放入盛有70%的酒精的EP管中。
2) 清洗:将上步骤中的EP管放入超声波清洗器中50KHz、29℃清洗15min。
3) 干燥:将清洗好的试虫放在干净的平皿中自然晾干。
4) 样品观察:将干燥好的试虫放在体视显微镜下进行观察,对主要的部位进行拍照。
2.3赤拟谷盗和杂拟谷盗头部RNA的提取
取50-100mg成虫头部组织放入液氮预冷的研钵中,加入少量液氮,快速研磨至粉末状,倒入有1ml细胞裂解缓冲液(1% SDS,50 mmol/L Tris-HCl, 25 mmol/L NaCl,25 mmol/L EDTA)的离心管中;
1) 在EP管中加入0.2ml的氯仿,上下震荡混匀,室温下静置5min ;
2) 将EP管放入高速冷冻离心机中,4℃ , 12000rmp 离心 15min,取上清;
3) 将约500ul的上清转移到离心柱中,加入250ul的无水乙醇,充分混匀,4 ℃ 12000rmp离心1min ,弃掉收集管中的废液;
4) 加入 500ulRNA漂洗液,静止1min,12000rmp离心1min ,弃掉收集管中的废液;
5) 将离心柱转移到无RNAse离心管中,加入30-50ulDEPC处理的水12000rmp离心1min。
收集提取的RNA放入-20℃的冰箱中备用。
2.4 cDNA第一条链的合成
1) 在灭菌的DEPC水处理后的EP管中分别加入1ul的3-RACEP1(0.5ug/ul)和2ul的RNA模板,用水补充至体积为13ul;
2) 将步骤1中的加完样的EP管放入70℃的水浴中5min,取出放入冰浴中冷却5min;
3) 在上面的EP管中根据下表依次分别加入这些试剂
成分 体积(μL)
5×第一链缓冲液 4
dNTP 2
核酶抑制剂 0.5
MMLV 0.5
加水至 20
4) 混匀EP管中的样,离心后,放置42℃ 水浴锅中60min;
5) 将EP管于95℃下加热5min,灭活反转录酶;
6) -20℃保存cDNA,备用。
2.5 TDT加尾反应
在微量离心管中配制下列反应液,全量为50ul,37℃下反应30min
成分 体积(ul)
5X TDT buffer 10
0.1% BSA 5
10mM DGTP 2.5
TDT 15
第一链合成产物 20
双蒸水 up to 50
2.6 LW视蛋白基因的克隆
2.6.1视蛋白LW基因的5'RACE 实验步骤