Outgroup Nicandra physaloides NHZ0001 Xiasha, Hangzhou, Zhejiang
Nicandra physaloides NHZ0002 Yiwu, Jinhua, Zhejiang
Nicandra physaloides NHZ0003 Jiujiang, Jiangxi
1.2研究方法
1.2.1 DNA提取与电泳检测
实验材料为新鲜酸浆属植物组织,采用生工生物工程(上海)股份有限公司的Ezup柱式基因组DNA抽提试剂盒(植物)提取基因组DNA,将得到的DNA溶液置于-20℃保存。具体步骤如下:将50-100mg的新鲜组织在液氮中研磨成粉末,转移至1.5ml离心管中;加入600ul65℃预热的Buffer PCB和12ulβ-巯基乙醇,混合均匀后置于65℃的水浴中25min;冷却至室温后加入600ul的氯仿,12000rpm离心5min,取上层水相200ul至干净的离心管中;加入200ulBuffer BD,混匀后加入200ul无水乙醇,将其全部加入到吸附柱中,静置2min,10000rpm离心1min,倒掉废液;将吸附柱放回收集管中,加入500ulPW Soultion,10000rpm离心1min,倒掉废液;将吸附柱放回收集管中,加入500ulWash Solution,10000rpm离心1min,倒掉废液;将吸附柱放回收集管中,12000rpm离心2min;取出吸附柱,放入一个新的1.5ml离心管中,在吸附膜中央加入50ulTE Buffer,静置3min,12000rpm离心2min,得到的DNA溶液置于-20℃保存。
琼脂糖凝胶电泳法检测DNA纯度和完整性:取5ul DNA样品与2ul 6×Loading Buffer混合,在1×TAE缓冲系统下,于含溴化乙锭(EB)(0.5ug/ml)的1%琼脂糖凝胶进行凝胶电泳,紫外凝胶成像系统(Bio-RAD,Universal HOODⅡ)拍照,观察点样孔亮度、条带亮度及清晰度、有无严重拖尾等现象来确定样品DNA的纯度和完整性。