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1997年，发生了首例人感染禽流感的事件，自此人们才发现禽流感病毒也可以感染到人[3]。特别是2013年2月和3月间，我国上海市、安徽等省发生了人感染H7N9禽流感病毒的事件[4]。此后，我国已经历了4波禽流感病毒的流行，目前正处于第5波流行期[5]。最近几年，陆续发生了H7N9感染人的病例，甚至于发生家庭聚集性人感染H7N9禽流感，说明禽流感传播可能发生突变，造成人-人传播[6]。已有研究发现，从人和禽类上分离到的H7N9病毒均在HA受体结合位点分别发生了G186V、G226L和T160A氨基酸替换；从人上分离到的H7N9病毒还发生了A138S氨基酸替换。这些突变在增加该病毒对人α-2,6唾液酸受体的亲和性的同时还保持了与禽类α-2,3唾液酸受体的结合力，导致H7N9病毒同时具备了人流感病毒和禽流感病毒的一些特征[7]。因此，实时了解流感病毒的流行及变异情况对于防控禽流感病毒有着至关重要的作用。
流行病学调查、检测是通过大规模的对各地的家禽进行采样、检测、测序、分析，从而及时了解禽流感病毒的流行情况以及禽流感病毒的变异情况，分析其遗传进化的特点，达到及时制定科学的防控政策的目的。种禽场是防控禽流感的第一道防线，因此实时监控种禽场流感病毒的流行情况，及时淘汰带病鸡对于种禽场的病毒防控非常重要。活禽交易市场中，大量不同种属、不同产地来源的禽类以极高的密度集中在一起，为AIV的基因重排和跨种间传播提供了很好的条件[8]。基因重排的结果便是新型流感病毒的产生，而尤为重要的是，有可能产生对人类具有高致病性的禽流感病毒。为此，我们对种禽场以及活禽交易市场的流感病毒进行实时监测，为了解流感病毒的污染状况和防控措施的制定提供技术支持。