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政府部门—区域科技资源的宏观调控机构 。地方政府是引导和参与科技创新资源配置并为提高其效率而提供保障与支撑的主体。政府部门的职能在于为科技资源的配置创造良好的市场和政策环境，鼓励科技创新和高新技术产业发展的科技资源扶持政策落到实处。政府主要是从战略高度充分考虑国家的政策和规划以及地区发展的现实情况，来确定地区科技创新资源的配置方向与领域，并主要通过提供科技创新的财力资源与信息资源来引导科技资源配置。如：地方政府可以通过编制科技计划等方式来促进高校、科研机构进行研究开发，鼓励产学研合作，通过完善的科技创新环境和平台来支持科技成果转化等措施，建立科技资源共享平台等等。
企业—区域科技资源的使用主体。 企业是利用科技创新资源进行技术创新的主体。企业研发的目的是开发新产品和新技术，并将其转化成现实生产力，提高其市场竞争力和赢利水平。企业可以通过对市场需求的分析，有针对性地选择有市场应用价值的研究开发对象，通过自主开发或与高校及科研院所的科技合作，来开发出具有市场竞争力的产品与技术成果，快速地将产品和技术成果推向市场,来实现科技成果的市场价值与经济效益。
高校、科研机构—区域科技资源的载体。高校、科研机构是区域科技资源的重要积聚地，是区域知识创新的主体。高校与科研机构主要从事的是基础研究和部分应用研究，一般不直接从事商业活动，对市场的敏感性较弱，但是其对研究领域前沿和技术发展动态的了解与把握要强于企业。又由于高校拥有丰富的人力资源，先进的实验设备、图书馆、实验室等丰富的科技物力资源，使得其成为区域创新系统中科技人力、物力和信息资源的重要供给源，为科技知识创新工作提供了良好的平台和有力的支持。关于科技资源配置主体的具体行为和特点参见表3-2：
表3-2：科技资源配置系统主体的比较
内容 宏观配置主体 微观配置主体
政府 企业 高校、科研机构
目的 实现区域经济发展的总体目标 研发新产品，提高市场竞争力 多出科技成果
作用 整体规划、宏观指导、公共基础设施服务 技术创新，将技术成果推向市场 知识创新、人才培养
地位 顶层管理 技术创新的主体 知识创新的主体
资源条件 科技经费、政策、需求信息 研发队伍、研发经费、市场信息 优势学科、创新团队、专利成果、科技信息
行为方式 制定和组织实施科技计划、财政拨款等 技术孵化、产品开发、市场开拓 科技项目研究、信息支持
关系 向微观主体进行政策配置和资金配置，引导其参与科技计划 接受政府科技计划任务、匹配科技资源、完成科技项目、反馈需求信息
二、科技资源配置客体
科技人力资源要素、科技财力资源要素、科技物力资源要素、科技信息资源要素作为科技资源配置客体，是科技资源配置主体作用的对象。科技人力资源要素作为最具能动性、创造性的科技资源要素，处于中心地位；科技财力资源要素为科技人力资源要素提供从事科技活动的财力供应；科技物力资源要素为科技活动的展开提供科研基础设施、仪器设备等支持；科技信息资源为科技活动提供科技成果等知识形态的科技资源的供应。