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戊二醛法 提取效率高，细胞破坏少，影响多糖测定 [18]
阳离子树脂交换法 提取效率高，对细胞破坏少 [19]
超声波法 提取效率低，细胞破坏少 [20]
高速离心法 较温和，细胞破坏少，但提取效率低 [20]
加热法 提取效率高，细胞破坏严重 [15;20]
一般而言，化学提取法提取EPS的效率一般要高于物理提取法，但是所得EPS容易被化学试剂污染。而且使用不同的提取方法得到的EPS，其得率和组分含量都会有不同的结果[21]。目前还没有一种统一的EPS提取方法。而离心法对细胞的破坏小，而离心又是常用的固液分离方法之一，故离心步骤是所有提取方法所共有的一步[22]。