拟南芥甘油-3-磷酸酰基转移酶(AtGPAT)基因的生物信息学分析(2)
在生物体中，甘油-3-磷酸乙酰转移酶（GPAT）催化的甘油-3-磷酸酯与脂肪酸的酰化反应是合成甘油脂类的第一步反应和重要的调控位点。所以对GPAT进行生物信息学分析有利于提高催化反应的效率，进而提高植物种子的油脂含量。
拟南芥是十字花科的植物，又名鼠耳芥。拟南芥是一种草本植物，广泛分布于非洲西北部和亚欧大陆。在我国的陕西，内蒙，新疆，甘肃等省区都有生长。因为拟南芥发育快，而且个体小，生命力强，可以大量培养，并且在解剖镜下比较容易观察细节，其还是严格的闭花自花传粉植物,可以确保稳定遗传，因此选用拟南芥进行GPAT的生物信息学分析。
甘油-3-磷酸乙酰转移酶在哺乳动物和人类的研究中已经非常充分[1]。目前已知的拟南芥中有10个GPAT基因成员，分别被命名为S1和GPAT1—GPAT9。根据酶的亚细胞定位的不同，可将其家族成员分为3类，分别为质体GPAT即S1[2] 、线粒体GPAT即(GPAT1、2、3)[3]和内质网GPAT即(GPAT4—9)[4-5]。GPAT1定位在线粒体膜上。已经有研究结果表明，GPAT4、GPAT6和GPAT8与角质的形成有关[6-7] 。而GPAT5与木栓质的形成有关[8]。GPAT4和GPAT8在茎和叶中呈优势表达，在花序中呈现强表达的则是GPAT6。本研究从NCBI数据库中下载拟南芥的GPAT蛋白序列，并按照序列特点和结构域进行聚类和进化分析，为进一步研究奠定理论基础。
下一篇：初中生物教师专业发展状况调查