油菜胁迫蛋白SAP家族成员挖掘与鉴定(2)
Key words:Brassica rape L; Stress-associated protein; Gene structure; Phylogenetic analysis
目 录
摘 要 1
引 言 3
1.材料和方法 3
1.1油菜相关胁迫蛋白SAP家族序列来源 3
1.2蛋白序列的基本信息的获取 3
1.3 油菜SAP蛋白的亚细胞定位 4
1.4油菜SAP蛋白家族的保守结构域分析 4
1.5油菜SAP蛋白进化分析和基因结构 4
2.结果与分析 4
2.1油菜SAP蛋白序列的基本信息 4
2.2油菜SAP 蛋白的基因定位和结构信息 5
2.3 油菜SAP 蛋白的亚细胞定位结果 6
2.4油菜SAP蛋白家族的保守结构域分析 7
2.5油菜SAP蛋白进化分析 8
3.讨论与结论 11
参考文献 12
致 谢 13
油菜胁迫相关蛋白SAP家族成员挖掘与鉴定 引言
干旱、盐、极端温度、高光、重金属等非生物胁迫，严重影响了植物的生长和作物产量，对农业生产造成巨大威胁[1]。非生物胁迫是全球范围内作物减产的主要原因，几种主要的作物平均减产高达50％以上[2]。为了适应各种胁迫环境，植物在长期的进化过程中发展形成了各种不同的分子、细胞和生理生化机制，最重要的是其产生诱导蛋白以抵御、适应各种不利生境[3]，其中SAP蛋白最为广泛关注。SAP蛋白组成一个重要的涉及胁迫应答和胁迫调控的基因家族，该家族具有A20/AN1锌指结构域特征[4]。对动物SAP蛋白的研究较为深入，比如肿瘤坏死因子（TNFα）等，但对植物SAP蛋白的研究报道相对较少。
2004年，Mukhopadhyay等从籼稻中克隆到1个含有A20/AN1锌指结构的基因，被命名为OsiSAPI，具有抵抗多种非生物胁迫的能力，是植物中发现的第一个SPA基因[5]。随后，在玉米、毛果杨、莱茵衣藻、粳稻、拟南芥、番茄等物种中的SPA基因相继被报道。目前，在已经完成基因组测序的植物中发现SAP蛋白广泛存在， 如水稻和高粱中均含有18个SPA基因，玉米中至少有11个SAP基因，毛果杨、番茄和葡萄的SPA基因家族分别有19、13和11个成员，拟南芥中有7个SPA基因，而低等生物莱茵衣藻中仅有3个[6-11]。
油菜栽培历史悠久，在世界各地广泛种植。中国是世界上油菜生产大国，常年生产面积1亿多亩，菜籽油也是我国人民的主要食用植物油，但油菜生产过程中经常受到干旱、寒冷、水分等非生物胁迫影响，常造成较大的经济损失。本研究利用生物信息方法和技术对油菜相关胁迫蛋白SAP家族进行挖掘与鉴定，从中找寻具有抗胁迫功能的油菜SAP基因，为选育具有抗逆性油菜新品种提供理论支撑。