2。6。2 琼脂糖凝胶电泳
(1)称取0。75g的琼脂糖粉末,放到一锥形瓶中,加入100 mL 1×TAE电泳缓冲液。然后置于微波炉加热至完全溶化,溶液均匀透明。冷却至60℃左右,在胶液内加入适量的核酸染料Goldview。
(2)取制胶板槽,水平放置胶槽,在一端插好梳子,在槽内缓慢倒入已冷至60℃左右的胶液,使之形成均匀水平的胶面,凝胶厚度约为3~5 mm。
(3)待凝固后,小心拔起梳子,使加样孔端置阴极端放进电泳槽内。
(4)在槽内加入1×TAE电泳缓冲液,至液面覆盖过胶面。
(5)取2µL待检测的PCR扩增产物样品与2µL loading buffer混匀后,用移液抢加至凝胶的加样孔中。在第一个加样孔中加入DNA Marker。
(6)连接电泳仪和电泳槽,并接通电源,设置电压为120v,电泳时间为30min左右。
(7)电泳结束后,小心取出凝胶块,放于凝胶成像仪中观察并拍照。来-自~优+尔=论.文,网www.youerw.com +QQ752018766-
2。6。3 菌株16S r-DNA序列测定与分析
经琼脂糖凝胶电泳检测后的PCR扩增产物送到上海生工生物工程有限公司进行测序分析,将测序结果提交到美国生物技术信息中心数据库NCBI(http://blast。ncbi。nlm。 nih。gov/)中进行核酸的Blast比对。
3 结果与分析
3。1 菌株分离与菌落形态观察
从莴苣田土壤中分离划线培养得到的菌株。如图3-1所示,该菌在LB培养基上生长3d后,菌落呈深黄色,圆形,直径约为1mm,表面凸起,光滑,边缘整齐。