进一步筛选蛋白功能未知的、基因成员在20个以上的家族,基因转录模式为:在侵染过程中高表达,最终确定研究的OGS_154821家族。
1。2 提取质粒及农杆菌转化
1。2。1 大肠杆菌质粒提取
使用AXYGEN公司的质粒提取试剂盒:
1)取4 mL在LB培养基中培养过夜的菌液12000 rpm离心1 min,弃上清;
2)加入250 µL Buffer S1(已加入RNase A)悬浮细菌沉淀,悬浮需均匀,不应留有小菌块;
3)加入250 µL Buffer S2温和并充分地上下翻转4-6次混合均匀使菌体充分裂解,直至形成透亮的菌液;
4)加入350 µL Buffer S3温和并充分地上下翻转6-8次,12000 rpm离心10 min;
5)吸取步骤4中的上清,加入配套的离心柱中,12000 rpm离心1min,弃滤液;
6)将制备管放回离心管,加500 Buffer W1,12000 rpm离心1 min,弃滤液;
7)将制备管放回离心管,加700 Buffer W2,12000 rpm离心一次;
8)将步骤7重复一次;
9)空甩离心柱12000 rpm,1 min;
10)将制备管放入新的1。5 mL的离心管中,在制备管中加60-80 无菌水,室温静置1 min,12000 rpm离心1 min,得到的即为质粒。
1。2。2 农杆菌转化
1。2。2。1 农杆菌GV3101感受态制备
1)从-70℃冰箱中取出GV3101甘油菌,用接种针在不含抗生素的LB平板上划线,30℃培养48 h,生长出单菌落。
2)牙签点新菌落于4 mL LB培养液中30℃ 200 rpm振荡培养2 d,取3 mL培养液于200 mL三角瓶中150 rpm振荡培养8 h至OD600=0。8后,冰上放置10 min。
3)分装入50 mL离心管中,天平平衡,5,500 rpm 4℃离心10 min。
4)弃上清,10 mL 100℃灭菌超纯水重悬,重悬尽量彻底无小块沉淀。天平平衡,5,500 rpm 4℃离心10 min。
5)重复4过程3次。 论文网
6)弃上清,加入2 mL 15%的甘油,用移液器轻轻吸打使细胞重悬。
7)冰上分装100 µL细胞重悬液于预冷的1。5 mL EP管中。
8)液氮速冻,于-70℃冰箱保存备用。
1。2。2。2 电击法转化农杆菌
1)取农杆菌(GV3101)感受态置于冰上,加入已经冰浴冷却的质粒或目的片段与质粒的连接产物,轻轻吸打均匀后转移到预冷的电击杯中;
2)2500 V电压电击后迅速取出电击杯,加入800 LB液体培养基,迅速吸打混匀后将菌液转移到1。5 mL EP管中,30℃,200rpm振荡培养1 h;
3)室温下5000 rpm,离心3 min,去除上清留下100 与沉淀混匀,在相应抗性的LB平板培养基上涂板,30℃倒置培养36-48 h;
4)转化鉴定:PCR验证阳性克隆。
1。3 RNA提取,逆转录和定量过程
1。3。1 RNA的提取(Invitrogen,DP320)
1)取1。5m EP管加入500µL TPK裂解液与10µL β-巯基乙醇;
2)取适量样品充分压干,加入液氮重恩碾磨,将研磨后的粉末加入前一步骤准备的裂解液中,震荡30s,室温放置;
3)低温离心机4℃ 14000rpm 离心10min,吸取800µL上清于新的1。5mL EP管中;
4)加入等体积的(400µL)的70% 无水乙醇。
5)混合液分两次加入离心柱中离心,4℃ 10000rpm离心30s。
6)向离心柱中加入300µL wash Buffer I,4℃ 10000rmp离心30 sec。离心后换用新的2mL EP管。
7)向离心柱加入500µL wash Buffer II(使用前要检查是否已加入无水乙醇),4℃ 10000rpm离心15sec。
8)重复步骤7。
9)弃离心液,空离,10000rpm离心1min。
10)将离心柱放入新的1。5mL EP管,向吸附膜的中间部位悬空滴加50 µL DEPC水,在室温下放置1min,10000rpm离心1min。