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碳酸钠法[4]：将蚕茧浸于碳酸钠水溶液中，在一定温度下，丝胶蛋白溶解于碳酸钠水溶液中而丝素不溶。通过过滤、离心等方法去除丝素后，再将获得的碳酸钠丝胶混合溶液进行透析、浓缩或干燥获得丝胶蛋白。碳酸钠法被广泛地应用于从蚕丝中分离丝胶蛋白，此方法在提取家蚕和非家蚕丝胶蛋白均有报道。Haesung Yu [5]等采用碳酸钠水溶液法从野蚕蚕茧分离提取丝胶，研究了碳酸钠浓度（C）和煮沸时间(T)对丝胶产率和丝胶分子量分布的影响，提出了采用 0。02 M碳酸钠煮沸 60 min 分离丝胶比较理想[5]。此方法丝胶产率高，但对丝胶的结构破坏比较严重。
酸析法：利用丝胶蛋白在等电点（pH 3。8~4。5）溶解度最低的特点，丝胶蛋白从水溶液中析出，再通过回收进而加以利用的方法。此方法常用于工业分离蛋白质。该方法的优势在于工艺流程简单，获得的丝胶蛋白纯度高，提取成本相对较低，但提取率不太理想。另外，由于调节溶液的酸碱度时常采用氢氧化钠和盐酸，这又会导致产物中因含有盐酸和氯化钠等杂质，使其无法直接应用于医药领域，因此该方法获得的丝胶蛋白仍需进一步纯化。最近几年也有关于采用柠檬酸代替盐酸提取丝胶蛋白的报道。
柠檬酸法[6]（Citric Acid）利用丝胶可溶解于沸腾柠檬酸水溶液中，而丝素不溶解的特性，将溶解后的丝胶柠檬酸混合溶液进行透析和浓缩即可获得丝胶蛋白。但此方法在透析的过程中丝胶蛋白会从溶液中析出，难以收集，而析出的丝胶难以复溶回溶液。