比较分子相似性指数分析法(CoMSIA）与比较分子力场分析方法（CoMFA）相比，CoMSIA是后来建立的3D-QSAR方法的发展。 原理是具有相同作用机制的一系列化合物的生物活性，主要取决于配体和受体非键之间相互作用强度的改变，力强度的变化来自每个配体周围的分子力场。与比较分子场分析方法（CoMFA）相比，CoMSIA方法的优点在于可以同时描述静电场，氢键供体场，分子周围立体场，疏水场和氢键受体场的变化，更全面地体现影响生物活性的分子各种结构信息。

2。2。3 Gaussion软件

Gaussian可以说是最广泛的半经验计算软件，也可称为从头计算量子化学软件。研究的内容主要包括过渡态的能量和结构，偶极矩和多极矩，化学键以及反应能量，分子能量和结构，热力学性质，原子电荷和电势，分子轨道，振动频率， NMR，红外和拉曼光谱，极化率和超极化率，反应路径。它还可以模拟计算在不同介质中的体系，同时模拟不同能级状态，计算周期边界体系。Gaussian是采用OPENMP的并行模式,针对共享内存的机器实现并行，方法简单。因此对于共享内存的机器，Gaussian能获得很好的性能。使用TCP Linda软件来实现对于跨节点的计算。TCP Linda可以把机群或者工作站虚拟成共享内存环境，导致用OPENMP实现并行的程序例如Gaussian软件在分布式内存的机器上能够运行。

2。2。4 SPSSS（Statistical Product and Service Solutions）数据统计分析

SPSS是一个采用图形菜单驱动界面的软件，是世界上用来统计分析最早使用的软件。它的操作界面非常友好，输出结果漂亮美观。它用Windows的窗口方式几乎将所有的功能都用对话框以统一、规范的界面展示出来，各种管理和分析数据方法都有对应的功能选择项。使用者只要对Windows有一定的了解，对一些基本的使用操作有一点掌握，就可以用这个软件为统计分析服务。SPSS使用的数据类似于EXCEL表格的方式进行导入或输入，使用较为简单，能够从其他数据库方便地读入数据，在较为成熟的、常用的统计过程下，即便是非统计专业的使用者也能完成自己的工作需要。SPSS的输出结果一般情况下为专用的SPO格式，十分美观清楚，必要时也可转存为文本或者HTML格式。对于比较熟悉老版本编程运行的使用者，可以应用语法生成窗口，使用菜单中的“粘贴”选项，将会自动生成所需的SPSS程序，为许多中、高级使用者提供了更大的方便。文献综述

SPSS for Windows就是一个组合式软件包，它可以用来录入、整理、分析数据。为了降低对使用者系统硬盘容量的要求，可以根据自己的需求和计算机的功能选择所需的模块。SPSS for Windows所给出的分析结果非常清晰直观、易学易用，可直接读取EXCEL和DBF的数据文件，在各种操作系统的计算机上都得到了广泛地推广。由于它使用起来操作非常简单，在我国的多个领域都做出来了巨大的贡献，比如经济学、社会科学、数学、自然科学、统计学、地理学、物流管理、心理学、生物学、体育、医疗卫生、商业、农业、林业等领域。

SPSS主要包括数据管理、统计分析、图表分析以及输出管理等几个基本功能。它的统计分析过程有描述性统计、相关分析、均值比较、回归分析、一般线性模型、聚类分析、对数线性模型、时间序列分析、数据简化、生存分析、多重响应等几大类，回归分析中又包含线性回归分析、非线性回归、Logistic回归、曲线估计、加权估计、Probit回归、两阶段最小二乘法等多个统计过程，在每个过程中都可以应用不同的方法和参数。SPSS还有绘图功能，能根据输入的数据绘制各种所需的图形。