2。5 基因的表达规律

 阐明欧洲云杉ABC基因的转录活性，有助于深刻认识这个家族ABC蛋白的功能情况。本研究选取22个不同发育时期的组织器官或不同条件下的同一组织器官为研究对象，利用生物信息学方法分析欧洲云杉205个基因的表达情况。表达数据直接从NCBI网站的SRA或GEO数据库中下载，将表达数据转化为Z-Score来表征基因表达量的高低，热图用R软件进行绘制。

3 结果与分析文献综述

3。1 云杉ABC蛋白的鉴定

将云杉蛋白组序列在Greenphyl数据库中下载下来[14]，然后将所有云杉蛋白组序列整理成文本文件，建立本地化的云杉蛋白组数据库；接下来，以ABC功能结构域（PF00005）的一致性序列为检索序列，利用本地化的BLAST工具在云杉蛋白组数据库中检索所有ABC超家族的成员；得到的ABC超家族成员蛋白序列被提交到Pfam工具，扫描这些ABC蛋白是否含有ABC功能结构域（PF00005）[15]，只有包含该结构域的蛋白被保留下来。

3。2 云杉ABC蛋白的分类情况

由表1可知云杉ABC蛋白可以划分为12[16]个类群。

A类群包括52个基因，例如：MA_10434414g0010、MA_11781g0010、MA_7398596g0010、MA_83166g0010、MA_657308g0010、MA_18604g0010、MA_121725g0010、MA_40611g0010、MA_8605679g0010、MA_712978g0020等基因。 

B类群包括20个基因，例如：MA_10432922g0010MA_180044g0010、MA_10432169g0010、MA_3437g0010、MA_62683g0010、MA_636449g0010、MA_107576g0010、MA_293226g0010等基因。

C类群包括16个基因，例如：MA_1824g0020、MA_10433482g0010、MA_14136g0010、MA_560534g0010、MA_270300g0010、MA_40328g0010、MA_889523g0010、MA_11459g0010、MA_141308g0010等基因。

D类群包括14个基因，例如：MA_108793g0010、MA_105476g0010、  MA_10427561g0010、MA_10432311g0010、MA_10433422g0010、MA_3894g0010、 MA_160238g0010等基因。

E类群包括14个基因，例如：MA_10432886g0010、MA_10428183g0020、 MA_4863g0010、MA_856g0010、MA_10435806g0020、MA_10101g0010、MA_81274g0010、MA_10436789g0010等基因。来自~优尔、论文|网www.youerw.com +QQ752018766-

F类群包括6个基因，例如：MA_8849g0010、MA_101915g0010、MA_85286g0010、MA_138036g0010、MA_42556g0010、MA_128615g0010等基因。

G类群包括4个基因，例如：MA_161096g0010、MA_142818g0010、MA_4340475g0010、MA_10426961g0010等基因。

H类群包括4个基因，例如：MA_9728818g0010、MA_5752096g0010、 MA_9877207g0010、MA_10435359g0010等基因。

I类群包括3个基因，例如：MA_144373g0010、MA_145446g0020、MA_145496g0010等基因。

J类群包括3个基因，例如：MA_331088g0010、MA_8900862g0010、 MA_10243343g0010等基因。

K类群包括3个基因，例如：MA_10437109g0030、MA_395455g0010、 MA_10436224g0010等基因。

L类群包括3个基因，例如：MA_890463g0010、MA_10109458g0010、 MA_10433697g0010等基因。