基于GPR40家族基因序列多态性分析中国黄牛的亲缘关系和起源进化(2)
引言
中国黄牛作为我国固有的家牛，在数量上就有优尔千多万头，它的品种相当繁多，已经编入《中国家畜遗传资源--牛志》（7）的地方品种就有了52个。所以黄牛是我国牛种中数量最多、分布范围最广的，也是驯化中最早的畜种之一，距今已有五到优尔千年的长久历史了。中国黄牛这个名称的得来虽然是由于毛色为黄色，但这并不说明所有黄牛的被毛都是黄色，而是在几千年的驯化当中，人们对牛的毛色进行选择性的遗留，从而形成了现在黄牛的统称。
中国黄牛的不断研究，出现不同观点的情况是很正常的。关于起源的问题就有很多看法，但是一般来说是认为来自于两种类型（8）：一是来自于原牛（Bos primigenius），另外一种认为是来自于野生瘤牛。不同的区域里，黄牛的外形上也会存在一些明显的差别。就以南方和北方为例，南方具有发达的劲垂和高的肩峰等瘤牛的特征，很显然在起源上它们是不一致的。
另一方面，外来牛种的引进对当地黄牛品种有一定的改良作用，弥补了当地品种生长发育慢，净肉率低等缺点。例如：夏南牛就是以法国的夏洛莱牛为父本，母本为南阳牛进行杂交从而得到的新品种。夏南牛比南阳牛体格大，生长发育快，屠宰率、净肉率高，肌肉嫩度好。产肉率同样高于南阳牛。但是引进新品种一样会对当地的品种带来冲击从而产生不可小觑的威胁。当地的黄牛品种会逐渐被取代，最后将濒临灭绝。所以对外来牛种的引进问题应谨慎处理，争取得到最优的解决方式。
中国黄牛许多品种的形成不是短时间内就可以完成的，这个过程是经过数千年时间慢慢演化过来的。地理隔离是其中一个原因，产生了北方牛、南方牛和中原牛这三种类型。当然自然选择和人工选择是必不可少的。我国的黄牛还根据产地、外形差异和生态特征等分成四个系（类群），分别为哈萨克牛、（西）藏牛、蒙古牛和南方牛。蒙古牛还会影响到我国北方的黄牛（包括中原），瘤牛的血统还会存在于南方黄牛的体内。而藏牛是在一个相对独立的不同的生态体系下发育和繁衍而成的。虽然看上去我国黄牛还有很多品种，但是如果不注意这些固有黄牛的品种资源保护，自古以来形成的黄牛品种将很有可能会因为与不同品种之间的杂交而导致宝贵资源的丢失。
随着市场需求越来越高，黄牛的来源和肉品质愈来愈受人们的关注，这就给肉牛产业带来了足够的机遇和挑战（9）。在其他动物研究中，GPR40基因与猪的肉质性状有关，它可能是影响猪肉色的分子遗传标记。由于猪与牛在遗传学上差异不是很大，所以可以确定GPR40基因家族也与黄牛的生长性状相关。
鉴于上述种种现象，本次研究选用了GPR40基因家族作为研究对象，通过对GPR40基因家族的扩增和测序，揭示其遗传多态性，对得出的结果进行综合性的分析，与已经存在的结果进行比较，通过更全面性的剖析从而更深刻地了解中国黄牛的起源与进化。
1 材料与方法
1.1 实验材料
1.1.1 实验动物
鲁西牛（LX）、秦川牛（QC）、郏县红牛（JX）、南阳牛（NY）、皖南牛（WN）、瘤牛（LN）、中国荷斯坦牛（HS）、蒙古牛（MG）、缅甸大额牛（DE）、夏南牛（XN）、草原红牛（CH）、安格斯牛（AG）、早胜牛（ZS）、晋南牛（JN）、延边牛（YB），牦牛（MN）。
上述黄牛和牦牛的血样共530个，分别进行了全血基因组DNA提取，共得到DNA样530个，获得的DNA用于扩增GPR40家族基因。所用血样的牛均为健康的成年牛。
1.2 实验试剂
1.3仪器设备
实验中所用到的主要仪器设备见图1-1。
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