鱼类性别分化关键基因的鉴定与系统进化分析
毕业论文关键词：鱼类;性别分化;序列特征；进化
Molecular Characterization and Systematic Analysis of Key Genes Encoding Enzymes Determining Sex Differentiation in Fish
Abstract: Gender differentiation refers to the fertilized egg on the basis of gender to female or male trait differentiation process. In the process of gender as a character, mainly depends on the restriction of the genetic material, with it we are here to study sex differentiation in key genes.It uses bioinformatics. Using bioinformatics methods on fish sex differentiation key gene sequence and evolution characteristics of systemic analysis.Protein sequence analysis showed that in the selected 54 protein, has found 10 conservative motif, including motif7 base sequence exists in all except TgSOX9 protein protein.The motif is highly conservate.Evolution analysis shows that the four types of gender genes does not choose site, belongs to the highly conserved sequence, no evolutionary adaptation.These results in order to further study which is the function of sex-determining gene and its key amino acid sites to provide the reference.
Keywords: Fish, Sex differentiation, Sequence feature, Evolution
目 录
摘要 4
引言 5
1 数据与方法 6
1.1基因选择与物种抽样 6
1.2基因序列检索与下载 6
1.3基因的序列比对与聚类分析 6
1.4 蛋白保守基序与功能结构域分析 7
1.5蛋白正选择位点的检测 7
2结果与分析 7
2.1 鱼类性别分化关键基因的鉴定 7
2.2 鱼类性别分化关键基因的序列比对与类群划分 7
2.3 鱼类性别分化关键基因编码蛋白的保守基序和功能结构域 10
2.4鱼类性别分化关键基因编码蛋白的正选择位点 12
3 讨论与结论 14
参考文献 15
附录 16
附表1 16
附表2 17
致谢 19
鱼类性别分化关键基因的鉴定与系统进化分析
引言
性别分化是指受精卵在性别决定的基础上进行雌性或雄性性状分化的过程。在这个过程中，性别作为一种性状，主要受遗传物质的制约，即我们这里所要研究的性别分化关键基因，但同时环境因素和激素等物质也起着及其重要的作用[1]。
性别分化是物种繁衍的基础，从目前的研究中可以发现，在动物中，性别分化主要分为以下几种：第一种是XY型性别决定，这种性别决定类型普遍存在于生物界中，其中XX会发育为雌性，XY会发育成雄性[2]。第二种是XO性别决定类型，大都存在于昆虫中，这种类型的主要内容是雄性为一个X，雌性为两个XX。第三种是ZW型，这类模型存在于鸟类，昆虫类中等。主要内容是ZZ发育成雄性，ZW发育成雌性。除此三种常见的性别决定类型以外，还有孤雌生殖和常染色体决定等类型。常染色体上基因决定的类型就与本文研究相关，常染色体体上的基因有DMRT、SRY、SOX9等[3]。