第一链合成产物 20
双蒸水 up to 50
1。5 UV视蛋白基因的克隆
1) 视蛋白UV基因的5'RACE 实验步骤
通过特异性引物进行巢式PCR,引物是通过生物公司合成见下表
表1-1 UV巢式PCR引物
Tab1-1 UV Nested PCR primers
接头引物
5RACEP1 5’-GCATAGGTATCAACGCAGAGCCCCCCCCCCCCCCCC-3’
5RACEP2 5’-GGCCACGCGTCGACTAGTAC-3’
特异引物
uv51 5’- ATGGAAACCATGGCCAACCATCTCGGTTG -3’
uv52 5’- TTAAGTCGTAGTCGTAGCACTTTGAGTTG -3’
第一轮PCR反应我们选取接头引物5RACEP1 5’- GCATAGGTATCAACGCAGAGCCCCCCCCCCCCCCCC -3’和特异性引物uv51 5’- ATGGAAACCATGGCCAACCATCTCGGTTG -3’两种按照表的反应体系进行加样:
成分 体积(μl)
TAQ plus DNA Polymerase(5 U/μl) 1
10×TAQ plus PCR Buffer 5
dNTP Mixture(各2。5 mM) 4
加尾产物 1
uv51(10pM) 2
F35H5R1(10pM) 2
灭菌蒸馏水 up to 50
PCR反应在BIOER PCR扩增仪上进行,95℃ 预变性5min,95℃ 变性40s,60℃ 退火30s,72℃ 延伸90s,35次循环,最后72℃ 延伸10min,取2μL扩增产物用0。75%(g/ml)含EB的琼脂糖凝胶电泳检测,凝胶成像系统观察并照相。
第二轮PCR反应我们选取接头引物5RACEP2 5’- GGCCACGCGTCGACTAGTAC -3’和特异性引物uv52 5’- TTAAGTCGTAGTCGTAGCACTTTGAGTTG -3’两种按照表的反应体系进行加样:
成分 体积(μl)
TAQ plus DNA Polymerase(5 U/μl) 1
10×TAQ plus PCR Buffer 5
dNTP Mixture(各2。5 mM) 4
第一轮PCR产物 1
uv52(10pM) 2
F35H5R1(10pM) 2
灭菌蒸馏水 up to 50
PCR反应在BIOER PCR扩增仪上进行,95℃ 预变性5min,95℃ 变性40s,60℃ 退火30s,72℃ 延伸90s,35次循环,最后72℃ 延伸10min,取2μL扩增产物用0。75%(g/ml)含EB的琼脂糖凝胶电泳检测,凝胶成像系统观察并照相。PCR产物电泳检测后,取适量纯化产物送至上海英骏生物技术有限公司进行PCR产物测序。