(4)蛋白酶检测培养基(1000 ml)
A液(500 ml):脱脂奶粉10。0 g,加无菌水定容至500 ml,分装后115 ℃,灭菌15 min
B液(500 ml):酵母提取物10。0 g,琼脂15。0-17。0 g,加无菌水搅拌混匀后定容至500 ml,分装后121 ℃灭菌20 min
灭菌后A液与B液1:1混合
(5)纤维素酶检测培养基(400 ml)
取2 g酵母提取物、0。4 g (NH4)2SO4、1。6 ml 50%甘油、0。04 g MgSO4、8 ml 50×磷酸盐缓冲液(350 g K2HPO4 + 100 g KH2PO4 + 1 L dH2O, 调pH至6。9–7。1,最后加入0。1 g/100 ml羧甲基纤维素钠和1。7 g/100 ml细菌琼脂粉,加纯水搅拌溶解后定容至400 ml,分装后121 ℃灭菌20 min。
1。1。3 抗生素及其浓度 本研究中涉及到的抗生素及其配制溶剂和浓度见表1-2。
表1-2 抗生素及其使用浓度文献综述
Table 1-2 Antibiotics and the application concentration
抗生素 缩写 溶剂 母液浓度mg/ml 使用终浓度μg/ml
卡那霉素 Km H2O 100 50
利福平 Rif C2H6O 100 100
硫酸庆大霉素 Gm H2O 100 50
1。1。4 菌株培养及保存 培养菌株E。 coli:液体培养一般在37 ℃摇床进行,200 rpm培养10-14个小时;固体培养在37 ℃培养箱过夜。培养菌株Pcc:液体培养一般在28 ℃摇床进行,200 rpm培养12-24个小时;固体培养在28 ℃培养箱1天。菌种保存:短期保存,Pcc划线或涂布于含抗生素的LA平板上,E。 coli保存在含相应抗生素的LA平板上,贮存在4 ℃冰箱,每3-4周重新划线保存;长期保存,将新鲜培养的菌液与等体积的50 %灭菌甘油充分混合后保存或冻干贮存于-70 ℃冰箱。
1。1。5 主要试剂和仪器 引物合成和测序由金智公司完成;细菌基因组DNA提取试剂盒、琼脂糖凝胶回收试剂盒和质粒提取试剂盒均购于Axygen公司;细菌RNA提取试剂盒购于Bioteke公司;限制性内切酶、T4 DNA 连接酶、r-Taq聚合酶、反转录试剂盒PrimeScriptTM RT Reagent (Perfect Real Time)Kit均购于TaKaRa公司;杂交用地高辛试剂盒购于Roche公司。冷冻离心机、PCR仪和分光光度计为Eppendorf公司产品;凝胶成像系统为Bio-Rad公司产品。
1。1。6 引物和限制性内切酶
表 1-3 本研究所用引物及其序列
Table 1-3 The sequences of PCR primers used in this study
Primers Primer sequence and Restriction Enzyme cutting site Restriction Enzyme Source
rsmB-F 5'-GGGGTACCCTTGAGCGTTGTATTCGT-3' Kpn I This study
rsmB-R 5'-CCCAAGCTTTGTTCTGATTCACGGATG-3' Hind Ⅲ This study
1。2 缺失突变体的构建
1。2。1 质粒的提取 质粒的提取参照OMEGA质粒DNA小量试剂盒说明书进行:
1)挑取所需大肠杆菌单菌落于含相应抗生素的LB培养基中37 ℃振荡培养16小时;