The name of primer Sequence (5'→3') Annealing temperature (℃)
1492R GGTTACCTTGTTACGACTT 52
27F AGAGTTGATCCTGGCTCAG
PCR 扩增体系(20 μL):PCR-Mix:10 μL;Primer(10 μmol/L):各 1。0 μL;DNA模板:1。0 μL;ddH2O:7。0 μL。
PCR扩增程序:94 ℃预变性2 min;94 ℃变性30 s,退火30 s,72 ℃延伸1 min,共32个循环;72 ℃最终延伸5 min。PCR结束后,将扩增产物用1。0 %琼脂糖凝胶进行电泳检测。
目的条带回收:采用DNA纯化回收试剂盒。用手术刀片将扩增出来的条带切割放入1。5ml EP管,后续操作按照回收试剂盒的说明书进行操作。纯化的目的条带的PCR产物送往上海桑尼生物技术有限公司进行测序,测序结果用BLAST进行相似性分析和同源性比对,通过 MEGA 4。0 软件,采用邻近法(Neighbor-joining)构建系统发育树。
1。2。6“生花”细菌性微生物药敏性试验[8]
采用纸片扩散法检测“生花”细菌的药敏性。纸片扩散法即kirby-bauer(KB)试验,是将含有抗菌药的滤纸片贴在待测细菌的营养琼脂平板上,药物在琼脂内向四周扩散的过程中,其浓度呈梯度递减,故在滤纸片周围一定距离内的细菌的生长受到抑制,经18~24h培养后形成抑菌环。
本次实验采用的抗生素种类主要有9种,分别为氯霉素、红霉素、庆大霉素、青霉素、环丙沙星、四环素、万古霉素、链霉素、氨苄西林。试验时,将沾有抗生素的滤纸片放置在涂有“生花”细菌性微生物的营养琼脂平板上,以空白滤纸片为阴性对照,置于37 ℃恒温下培养16 h,观察沾有抗生素的滤纸片周围是否出现透明圈,透明圈的大小直接反映“生花”细菌性微生物对抗生素的敏感程度,无透明圈的表示“生花”细菌性微生物对抗生素不敏感,抑菌圈小于10 mm的表示低敏,在10~15 mm之间的表示中敏,大于15 mm的表示高敏。来*自~优|尔^论:文+网www.youerw.com +QQ752018766*
1。2。7“生花”微生物毒力基因检测
微生物感染致病是一个复杂的、动态的多因子作用过程,它需要众多毒力基因产物共同作用,因此通过毒力因子的检测,可以初步地判断“生花”细菌是否具有毒害作用。
本实验采用PCR方法进行毒力基因的检测。首先,经过菌种鉴定明确“生花”细菌的类型之后,从参考相关文献找出毒力基因引物序列或者通过序列登陆号从NCBI上获得基因序列并利用引物设计软件Primer Premier 5。0进行引物设计;其次,破碎“生花”细菌的菌体以获得DNA模板,按照PCR反应体系和反应条件,进行PCR扩增。PCR 扩增体系(20 μL):PCR-Mix:10 μL;Primer(10 μmol/L):各 1。0 μL;DNA模板:1。0 μL;ddH2O:7。0 μL。PCR扩增程序:94 ℃预变性2 min;94 ℃变性30 s,退火30 s,72 ℃延伸1 min,共32个循环;72 ℃最终延伸5 min。然后,扩增产物用含EB的1%琼脂糖凝胶电泳检测,以16SrDNA作为阳性对照,电泳结束后,用手术刀片将扩增出来的条带切割放入1。5 ml EP管,后续操作按照回收试剂盒的说明书进行操作;将纯化的目的DNA送往上海桑尼生物科技有限公司进行测序;最后,将测序结果进行BLAST比对,确定是否为毒力基因