PLC的运行周期分为3个阶段，输入采样阶段、程序执行阶段以及输出刷新阶段[17][18]。第一个阶段时PLC逐个扫描每个输入端口，将当前状态保存到对应的存储区域。所有的输入状态变化都要在下一个周期才能被PLC接收。第二个阶段时程序执行阶段，CPU扫描程序，按照先上而下，自左而右的顺序来读取梯形图的程序。所有的程序都被扫描一遍后，输出会依次被刷新，系统进入下一个阶段。在输出刷新阶段，所有的输出通过输出端子输出，驱动与PLC相连的负载。